电子结肠镜检查与一般肠镜检查是两种不同的方法。在进行无痛肠镜检查时，病人会先进行全身麻醉，所以不会感觉到任何疼痛。
但如果是一般的肠镜检查，由于检查设备有可能会刺激肠道粘膜，导致疼痛，需要做好肠镜检查。做完肠镜检查后一定要避免吃辛辣刺激性的食物，避免出现腹泻、腹部疼痛等情况。短时间内建议饮食以清淡为主。
进行肛门检查，首先应当选择合适的体位，可选择膝胸位、截石位、弯腰俯卧位，有时也可以采取左侧卧位，选择合适的体位，对检查疾病有很大的帮助。首先应当进行肛门视诊，观察肛门的位置是否有异位变形等。然后观察肛门周围的皮肤及颜色，是否存在着红斑、糜烂、渗出，是否有肿物。
胃镜检查时，医生右手持镜前段将胃镜放入舌根部，此时病人进行吞咽动作，将胃镜送入食道，而后继续向下送镜子观察胃及十二指肠情况。肠镜是利用一条装有微型摄影机的纤维软管进行检查，其由肛门进入肠道，顺势观察肠腔情况。
如果出现结肠直肠病变，可以进行纤维结肠镜检查。如果进行肠镜检查，可以排出一些肠道器质性病变，比如肠道炎症，肠道肿瘤，肠道息肉等。一般检查结肠和直肠是否有占位病变、良性和恶性肿瘤是可能的。结肠憩室、息肉、溃疡、各种结肠炎症等。如有可疑病变，可进行病理活检以确认诊断，并根据诊断采取相应的治疗措施。
检查前应该先做一下常规检查，包括了血常规检查、尿常规检查、心电图检查等，以掌握身体基础状况。进行肠镜检查前3天就应该进行清肠准备，只要做好饮食护理措施，最好吃一些无查或者少查的流食或半流食，以便于检查当天清空肠道时比较方便。有些女性进行肠镜检查时比较紧张，对检查顺利进行也会造成影响，因此一定要注意放松心情。
