阴道炎支原体衣原体感染，平常一定要注意个人卫生，私处要天天清洗，要注意多休息，注意良好饮食习惯，也可以去医院确诊原因后对症治疗，治疗期间不要同房，不要做剧烈的运动。
呼吸道衣原体感染属于感染性疾病。
当发现呼吸道衣原体感染时，要使用抗生素进行抗炎治疗，此类病人对大环内酯类抗生素较敏感，如罗红霉素分散片、红霉素肠溶片等。衣原体感染多发生于机体免疫相对较低的情况下，在进行治疗的同时，要从日常的生活饮食中进行一定的调节，降低发病的机会。导致咳嗽，咳痰等，则配合镇咳祛痰药。
尿道衣原体感染一般不能自愈。
衣原体尿道炎如果不能自己痊愈，可以通过尿道分泌物进行细菌培养，再进行药物敏感性测试，选择敏感的抗生素进行治疗，可以治愈尿道炎，但不太容易自愈。患者可遵医嘱使用四环素、红霉素、阿奇霉素、氟喹诺酮类等药物进行治疗。
生殖道衣原体感染一般要治疗两周的,但治疗期间是可以工作的，通常不需要住院治疗。
由于衣原体的存在，会引起尿道炎、盆腔炎、输卵管炎等部位的炎症，对于不同部位的感染，治疗效果不一样。对于衣原体感染的患者，临床多选择四环素类、大环内酯类抗生素，阿奇霉素、红霉素、多西环素、米诺环素等最为常见。
生殖道衣原体感染是指生殖系统内侵入了衣原体这种病原体后引起的感染性疾病。
女性发生生殖道衣原体感染，以宫颈炎为主，而男性则以非淋球菌性尿道炎为主。在临床上，针对生殖道衣原体感染，可使用抗生素进行治疗，常见的是头孢类抗生素，用药应谨遵医嘱，不可自行用药，以免引起身体不适。
以肺部感染为例，肺炎衣原体的感染潜伏期是10-65天左右，开始的表现是上呼吸道的感染，比如咽痛、声音嘶哑、流鼻涕，以咽痛最为常见。1-4周的时候出现比较明显的症状比如发热、咳嗽，发热可以持续1-7天，咳嗽以干咳为主，体检可以闻及干湿性啰音，偶尔会有肋胁痛，部分的患者可以出现哮喘。
