丛集性头痛的发病原因是下丘脑参与发病机制，就是所谓的生物钟学说。下丘脑是内分泌和神经系统的调节中心，丛集性头痛的发作有着昼夜节律的规律，同时伴有一些自主神经的症状。
丛集性头痛有自愈的可能，丛集性头痛发作时间一般持续数周或者数月以上，除头痛外，可伴有结膜充血，眼睛干涩、流泪，甚至眼眶疼痛，可用激素或特异性止疼药物治疗，比较好。
丛集性头痛好发年龄在20—50岁，平均为30岁左右。一侧眼眶周围周期性爆炸性疼痛，伴痛侧眼睛流泪、结膜充血、鼻塞流涕是本病的主要临床特点。疼痛常起源于一侧眼眶周围向三处即同侧颞区、前额、下颌区放散，每次发作绝大多数在同一侧，只有极少数转移到对侧。疼痛呈剧烈深在性，无搏动性，性质为爆炸性，偶有阵发性针刺样或冰刺样疼痛。
丛集性头痛是所有头痛中比较严重的一种，属于血管性头痛之一。发作时无先兆，头痛固定于一侧眼及眼眶周围。发作多在晚间，初感一侧眼及眼眶周围胀感或压迫感，数分钟后迅速发展为剧烈胀痛，并向同侧额颞部和顶枕部扩散。常伴发情绪障碍，头痛时十分痛苦，坐卧不宁。
丛集性头痛的治疗主要分为发作期治疗和缓解期治疗。发作期可以使面罩吸氧，一般吸入纯度为100％的纯氧，一般起效比较快。缓解期的治疗一般根据发作的频率和发作的时间选用不同的治疗。
是下丘脑参与发病机制，就是所谓的生物钟学说。下丘脑是内分泌和神经系统的调节中心，丛集性头痛的发作有着昼夜节律的规律，同时伴有一些自主神经的症状，这方面说明下丘脑参与了丛集性头痛的发作。