一般来说，对于甲状腺功能亢进的药物，其不良反应主要有三种：
第一种情况，就是服用了药后会有皮疹，这属于一种过敏性的症状，一般会在全身和身体的不同地方都会有皮疹。
第二种是肝功异常，转氨酶增高是甲亢病人的主要症状，肝功异常、转氨酶增高等都很常见。
第三是由于服用了甲亢药物，导致白细胞减少，白细胞的总量减少后，嗜酸性粒细胞的绝对数值也会减少。
组织出血是抗凝药物主要的副作用。不同部位有不同的表现，但使用抗凝药物脑出血的发生率非常低，总体年发生率为0.5％。出血的发生与监测的INR及年龄的升高相关。服抗凝药物华法林一定要监测INR，及时、有效的监测是保证安全、减少出血的前提条件。
这种由于孕激素量很大，容易引起恶心呕吐；可能会在短期内引起月经紊乱，所以不提倡经常吃这种药物避孕失败率非常高，而短效避孕药或节育器的成功率高。这种不能作为常规用药，但是有需要还是要吃的，在没有避孕措施的性生活后服用，可以作为后备手段。
肝移植抗排斥反应的药物有很多，主要包括糖皮质激素、抗增殖的药物、T细胞介导的免疫抑制剂等。抗排斥药物副作用主要包括肝肾功能损害、心血管系统损害、神经系统损害、癫痫发作、顽固性高血压、糖尿病、抗排斥药物中毒等。
抗癫痫药物的副作用有胃肠道的不适，如恶心、呕吐，可出现头晕、头疼、嗜睡、视物双影、肢体活动的共济失调。抗癫药物的副作用还可以表现为血细胞的异常，如白细胞减少或血小板减少；还可以引起肝功能的损伤。
安眠药的副作用有：
一、是中枢神经系统的抑制。一般是安眠药的镇静作用引起的，患者会出现嗜睡、肌肉无力、身体协调困难等。
二、迷茫和迷失方向。这种情况多发生在老年人身上，可能会出现一定时期的暂时性失忆。但临床上并未证实服用安眠药与痴呆有直接关系。
三、其意的急躁作用。一些之前有攻击性行为或情绪不稳定的患者，服药后可能会变得暴怒或暴力，或出现幻觉，即欣快，可能会引起更严重的失眠。这可能是一种类似于服用安眠药后醉酒的失控现象。
四、抗胆碱作用。部分患者服药后会出现轻度视物模糊、口干等症状。
