进行肛门检查，首先应当选择合适的体位，可选择膝胸位、截石位、弯腰俯卧位，有时也可以采取左侧卧位，选择合适的体位，对检查疾病有很大的帮助。首先应当进行肛门视诊，观察肛门的位置是否有异位变形等。然后观察肛门周围的皮肤及颜色，是否存在着红斑、糜烂、渗出，是否有肿物。
早期肛瘘通过直肠肛门指检，可以摸到条索状的一个管道、大部分通过目测和直肠肛门指诊即可检查出来，少部分复杂或难以确诊的，做腔内超声或者是肛周超声或核磁共振进行确诊，通过直肠腔内超声，能够发现直肠肛围的脓肿、管道等。
粪便脓液-粪便脓液检查，检查方法简单，结果直观，肛门指检-肛肠疾病是临床常见的疾患。其中以痔疮、肛周脓肿、肛瘘、直肠良、恶性肿瘤居多。绝大多数的肛肠疾病可通过肛门指检作出初步诊断，而肛门指检又是极为方便的措施。
胰腺疾病是一个非常复杂的病种，检查手段有很多，通常通过以下辅助检查进行诊断：腹部彩超、CT、核磁共振、十二指肠镜、血淀粉酶、尿淀粉酶化验等检查，但是，具体要选择哪一种，应该根据不同的病情来确定。首先可以选择腹部彩超，彩超观察不清或者可疑有病变的时候，可以选择腹部CT或者核磁检查。
早期脱肛排便时直肠脱落，便后能自然复位。日就失治，直肠全层或部分乙状结肠突出，甚至咳嗽、负重、行路、下蹲时也会脱出，而且不易复位，需要用手推回或卧床休息后，方能复位。所以早期应当到正规三甲医院就诊，并通过手术治疗，保守治疗意义不大。
