肾结核最常见的临床症状为膀胱刺激征，即尿频、尿急、尿痛，多数为肾结核的首发症状。另外肾结核病人可出现肉眼血尿，多为终末血尿，也可表现为全程血尿，部分病人可出现脓尿，呈米汤样，可混有血丝。
肾结核的症状也会有全身结核的一些表现，表现就是乏力、盗汗、纳差。乏力就是觉得身上没有力气，盗汗就是身上睡着觉以后会不自主地有出汗。低热，就是有温度不超过38.5℃的发烧，37.3℃以上，38.5℃以下。
肾结核经过半年至1年左右的抗结核内科药物治疗后，患侧肾脏因为结核而失去功能，由于患侧肾脏因为结核而钙化，包裹，形成结核性脓腔内有结核菌存在，抗结核药物无法到达，因此必须手术切除失去功能的肾脏。
肾结核都会转移，肾结核主要就是结核分枝杆菌通过血行由其它部位的感染而至，常见的就是肺结核传染。肾结核发展到一定的程度，会有大量的结核杆菌由肾脏排到输尿管，排到膀胱，甚至通过前列腺汗逆行感染，或者射精管逆行感染到前列腺、输精管、睾丸、附睾等，会导致前列腺结核、睾丸附睾结核、输精管结核等。
肾结核可以治好，肾结核的临床表现与病变侵犯的部位及组织损害的程度有所不同，病变初期局限于肾脏的某一部分则临床症状甚少，仅在检验尿液时有异常发现，肾结核不仅会造成泌尿系统功能障碍，严重者还会出现肾衰竭。
