肺结核的治疗最主要是针对结核分枝杆菌的抗痨治疗，抗痨药物有很多种，它们的副作用根据不同药物种类而不相同。可能会引起肝损伤，还会导致血尿酸升高，出现关节痛的现象。副作用大的情况下要赶快停药。
肺结核药物的常见副作用有恶心、呕吐、腹部不适等胃肠道反应，还有肝、肾功能损害等严重不良反应，尤其是毗嗪酰胺、利福平等药物。结核病还可能导致关节痛和视神经的损害，这种情况往往是由服用乙胺丁醇引起的。肺结核患者在出现明显副作用时，可以在医嘱下调整目前所用药物，并添加维生素、甲钴胺或护肝药物等，必要时应暂停治疗。
吃结核药的副作用可能会出现周围神经炎，表现为头疼，头晕，精神错乱，呕吐，胃疼，肝毒性，可出现一过性转氨酶上升，严重者伴黄疸。也可能会出现肝损伤，食欲不振，关节痛，恶心等。
肺结核药物主要是对肝脏有损伤，所以在应用抗结核治疗药物应该定期监测肝功如果肝功一场还需要保肝治疗，对心脏是没有副作用的。肺结核药物副反应较多，常表现为食欲不振、恶心、全身关节酸痛、精神差，严重者可出现视力、听力下降，且有呕吐、肝肾功能异常、精神症状等。
结核菌对高温其实也是敏感的，通过高温蒸煮、高温灭菌能起到很好的效果，结核菌除了对高温，对一般的紫外线是很敏感的，通过紫外线消毒，紫外线照射结核菌很快的就会被灭活。
服药期间，增添含蛋白质高的食物，增强自身体质。要安排好生活起居，早睡早起，不从事重体力劳动，防止过度疲劳，加强营养，多吃新鲜的鱼、肉、鸡蛋、牛奶、水果、蔬菜等，忌吸烟、酗酒、辛辣食品。
