子宫内膜异位囊肿可能会影响怀孕的，医院做一个全面的检查，然后针对性的治疗，子宫内膜异位症，是造成不容易怀孕的原因之一，所以应该积极治疗，治疗子宫内膜异位，可以通过药物或者是手术的方法治疗来，建议，药物治疗是通过假孕或者是绝经的疗法治疗，假孕疗法是通过孕激素。
子宫内膜异位症是有生长功能的子宫内膜出现于正常子宫内壁以外的部位，子宫内膜异位症的主要方法就是手术治疗，因为这样的方法可以在直视下可以基本上明确病灶范围和性质，对解除疼痛，促进生育功能效果较好，术后要注意护理，要注意个人的饮食习惯和生活习惯，这样才能让身体尽快的恢复，同时术后，不要急着怀孕等身体完全恢复后再进行怀孕。
子宫内膜异位症手术后，手术后体质虚弱，身体抵抗力下降，术后注意休息，加强营养，多吃富含蛋白质和维生素丰富的食物，有利于身体的恢复和伤口的愈合，少吃生冷，寒凉辛辣，有刺激性的食物。术后一周就可以适当的活动了。术后身体完全恢复正常，大约需要一个月左右。
子宫内膜异位的治疗药物治疗；手术治疗，年轻或尚需保留生育机能的，可行子宫内膜异位囊肿剥除术及病灶切除术为保守手术；对不要再生育的，可行全部子宫及病灶切除，保留一侧或双侧部分卵巢，术后辅以药物治疗，复发率较低；近绝经期的妇女可治好手术，行全子宫、双卵巢、输卵管切除术以及病灶切除术可避免复发。
一般情况下，卵巢囊肿通常不是子宫内膜异位。具体分析如下：
卵巢囊肿包括生理性囊肿，还有卵巢巧克力囊肿、畸胎瘤、黄素囊肿等病理性的囊肿。只有卵巢巧克力囊肿是由子宫内膜异位所造成的，它会伴随着女性来月经的次数而逐渐增大。因此卵巢囊肿通常不是子宫内膜异位。患者出现不适症状，应该及时就医检查，根据检查结果对症治疗。
子宫内膜异位囊肿可以运动，但是，一些相对比较剧烈的运动尽量不要做，以免导致囊肿蒂扭转。日常生活中按时作息，避免过度劳累，注意局部卫生，尤其是例假期间更要多加注意，尽量避免剧烈运动，禁止性生活。