巧克力囊肿不严重是可以治疗好的，可以采用中药治疗并定期随访检查，中药通过活跃肝脾之脏腑，可以达到调节气血平衡、全面调理内分泌系统进而治疗巧克力囊肿的目的，但是也可以选择其他治疗方法，比如保守性手术、激素疗法等。
卵巢巧克力囊肿又名卵巢子宫内膜异位囊肿，是子宫内膜异位症的一种病变。其症状主要是痛经进行性加重、性交疼痛、不孕及月经失调，如要治疗还用手术治疗。日常避免高度紧张及精神刺激，要保持乐观情绪以及充足的睡眠，保证良好的生活习惯；平时饮食要清淡有营养，纠正偏食及不正常的饮食习惯，不宜常食刺激性食物、海产品等。
注意调整自己的情绪，保持乐观开朗的心态，使机体免疫系统的功能正常。要注意自身保暖，避免感寒着凉。月经期间，禁止一切剧烈体育运动及重体力劳动。如已查出患有子宫内膜异位症，卵巢巧克力囊肿大于6cm以上者，在月经期或月经中期一定要注意保持情绪稳定，避免过度劳累，一旦囊腔内张力突然升高时，囊壁破裂，会形成急腹症。月经期要做好自身的保健，注意控制自己的情绪，不要生闷气，否则会导致内分泌的改变。
巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种病变，小的巧克力囊肿一般对身体没有什么影响，巧克力囊肿比较大容易造成卵巢、子宫病变，导致痛经，甚至引起不孕等。所以如果巧克力囊肿大于五厘米需要及时手术治疗，预防破裂或者扭转的情况。
巧克力囊肿症状：痛经是子宫内膜异位最明显的症状，却是最容易忽略的先兆，常进行性加重。这也是一个明显的信号，可能还伴有点状出血，卵巢巧克力囊肿的症状并不是十分的明显。在不孕的女性中，子宫内膜异位造成的不孕占有很高的比例。
卵巢巧克力囊肿是卵巢囊肿的一种。临床资料显示卵巢囊肿患人有50克囊肿。患有这种疾病的人很难怀孕，因为囊肿会阻塞卵巢，从而削弱卵巢产生卵子的能力，并极大地影响卵子的质量。此外，如果囊肿堵塞输卵管，即使能产下卵子，卵子也不能进入子宫，这也会导致不孕，所以更难受孕。
