卵巢巧克力囊肿是卵巢囊肿的一种。临床资料显示卵巢囊肿患人有50克囊肿。患有这种疾病的人很难怀孕，因为囊肿会阻塞卵巢，从而削弱卵巢产生卵子的能力，并极大地影响卵子的质量。此外，如果囊肿堵塞输卵管，即使能产下卵子，卵子也不能进入子宫，这也会导致不孕，所以更难受孕。
正常卵巢囊肿不治疗，自己好的可能性很小，特别是年轻女性激素活动频繁，更降低囊肿的自愈几率。如果不治疗可能会变大，卵巢囊肿万一变大，就可能使下腹或背部隐隐作痛或感到肿胀。
巧克力囊肿一旦破裂就会使得输卵管被堵，导致卵巢的排卵功能无法正常运行，降低受孕几率。积血流到盆腔就会使得出现小腹疼痛、月经不调、性生活疼痛等现象，并且导致盆腔器官粘连在一起，引起腹膜炎卵巢巧克力囊肿又名卵巢子宫内膜异位囊肿，是子宫内膜异位症的一种病变。这种囊肿可以逐渐增大，有时会在经期或经后发生破裂，但很少发生恶变。卵巢巧克力囊肿虽然是良性疾病，却有增生、浸润、转移及复发等恶性行为。
巧克力囊肿院行腹腔镜手术，现医院检查发现复发，卵巢巧克力囊肿特点就是容易复发，特别是对于年轻女性。饮食上没有特别需要注意的，少吃点豆制品，如果巧囊不大，可以不用治疗，如果巧囊大了，可以再次考虑手术剥除。
卵巢巧克力囊肿的常见症状，性生活痛、这是卵巢巧克力囊肿最明显的症状，子宫直肠窝阴道后穹隆，宫骶韧带等部位的子宫内膜异位症等均可发生性生活痛，而且常于月经前较为明显；白带异常；痛经；即使没有避孕也不会出现怀孕的情况。