头孢拉定是第一代头孢，头孢克肟是第三代头孢。头孢拉定对革兰阳性菌的杀菌作用强于第三代头孢；对各种倍他内酰胺酶的稳定性比头孢克肟差；对肾脏有一定毒性，与庆大霉素等氨基甙类抗生素或强效利尿剂合用时会加剧其毒性。而头孢克肟抗菌谱比头孢拉定广，抗菌活性更强；对倍他内酰胺酶稳定；对头孢拉定治疗无效的产生倍他内酰胺酶的细菌治疗有效；对绿脓杆菌等革兰阴性杆菌具有良好的抗菌作用；对肾脏基本无毒。
头孢克肟是第三代头孢菌素，而头孢克洛是第二代头孢菌素。因此两者的抗菌谱有所不同。第二代头孢菌素对革兰氏阳性菌杀菌效果优于第三代。而第三代抗菌素对革兰氏阴性菌杀菌效果优于第二代。而且第三代抗菌谱更广，还对一些比如像铜绿假单胞菌有一定效果。有些肺炎，尿路感染，腹泻病人可以用头孢克肟。头孢克洛多用于上呼吸道感染。
头孢克肟具有消炎的功效，主要用于敏感菌引起的毛囊炎、传染性脓疱疮、丹毒、皮下脓肿、乳腺炎、肛周脓肿等皮肤感染。头孢拉定具有杀菌的功效，可用于敏感菌引起来的呼吸道，泌尿道，肠道，软组织感染等。
头孢克肟和头孢克洛都属于头孢菌素，头孢克洛为第二代头孢菌素，主要通过抑制细菌细胞壁的合成杀菌作用，对大部分的革兰阳性球菌和革兰阴性杆菌都有杀灭的作用。头孢克肟属于第三代头孢菌素类抗生素，头孢克肟对革兰阳性杆菌产生的β-内酰胺酶高度稳定。
两者都为头孢二代类的抗生素，如果有明确的区别来看，可能跟个人的使用习惯不同，两者均对革兰(+)有较强的抗感染的作用，所以，不管是对上呼吸道感染还是下呼吸道感染，都可以用头孢丙烯或者头孢克洛等治疗。
头孢克肟胶囊和阿莫西林都属于一种消炎药物，阿莫西林属于青霉素类的，头孢克肟片是属于头孢类的药物，他们都是消炎药，但是不是一类药，治疗发烧感冒，头胞克肟效果好点。
