对于诊断不明确者，可进一步鉴别肺结核、支气管结核、肺癌。通过纤维支气管镜刷检、活检。可以显著提高肺结核的诊断的。支气管镜主要应用于明确肺部肿块性质。寻找可以和阳性痰细胞的起源。对于顽固性咳嗽可以做纤维支气管镜检查明确病因。辅助诊断不明原因的喘鸣。诊断咯血及痰中带血病可进行镜下局部治疗。
肺结核是呼吸道常见的传染性疾病，气管镜是诊断肺结核非常常用，也是非常重要的一种方法。但是，仅仅依靠气管镜还不能完全的诊断肺结核，还需要结合一些其他的检查来进行综合分析和判断。
纤维支气管镜检查是诊断气管、支气管结核的重要方法，对于诊断不明确者，可进一步鉴别肺结核、支气管结核、肺癌。另外，通过纤维支气管镜刷检、活检。可以显著提高肺结核的诊断的(+)。
支气管镜检查肺结核有很多种方法，支气管镜下灌洗检查，对检查部位的支气管进行灌洗，灌洗液或气管内分泌物去做结核分枝杆菌实验。或者是支气管镜下取活检，主要用于支气管内膜结核，特别是有肉芽增生和淋巴管漏者，也是鉴别肿瘤的常用检查。
支气管结核和肺结核有以下区别：主要是结核的原发部位不同，肺结核通常原发于肺上，就是普通理解的肺结核；支气管结核就是原发于支气管里面，包括整个主支气管及支气管，以前也叫支气管内膜结核。其他的区别是治疗疗程以及对预后的影响区别，肺结核的。治疗疗程一般在6-9个月，而支气管结核疗程时间会更长，1年甚至24个月都有可能。
支气管扩张与肺结核同属于常见的呼吸系统疾病,两者存在多方面的不同,临床大多以咳嗽、咳痰、咳血等为主要表现.首先是两者的致病原因不同,导致肺结核的原因为结核分枝杆菌的感染,是常见的传染性疾病,主要通过呼吸道飞沫以及密切接触传播.导致支气管扩张的原因比较多首先来自于一些感染性的因素，比如一些细菌、病毒、真菌等感染，造成肺组织慢性进行性的损伤。
