一般情况下，益生菌能治疗小儿便秘。具体情况分析如下：
小儿便秘与饮食不当有一定的关系，可以服用益生菌进行调理，可以通过观察治疗来消除直肠中的坎墩粪便，可以服用泻药来减轻，如果病情严重，可以使用生理盐水来缓解，第二种是导泻剂，如：渗透性泻剂乳果糖、聚乙二醇等。平时一定要养成良好的饮食习惯，多吃新鲜的水果、蔬菜等，经常去卫生间等。
儿童便秘可以挂消化内科的，平时可以使用一些肠道益生菌，要注意让孩子多喝水，多吃一些新鲜的水果。要注意避免给孩子吃辛辣刺激性的食物，以及不易消化的食物，平时可以多些运动。
益生菌可以调节胃肠功能，帮助消化，促进胃肠蠕动。调节肠道内菌群失调。无论是二联枯草杆菌还是三联活菌疫苗这些益生菌都是可以的。这些都可以增加肠道有益菌的数量，消化不良等症状都有很好的治疗效果的。
便秘的病人是可以通过服用益生菌来调理肠道的，但是这个过程是比较长的，一般得需要调理2-3个月才能见效，另外还需要减量巩固一段时间，逐渐的停用益生菌，常用的益生菌。平时的时候也可以吃一些粗纤维的食物。
小儿便秘可能是上火、胃肠道功能紊乱等原因导致的。具体分析如下：
1.上火：饮食不当可能会导致脾胃积热，引起小儿上火，可能会出现便秘的情况，同时伴有舌质红、口唇干燥等症状。
2.胃肠道菌群紊乱：小儿的胃肠道功能比较脆弱，进食不当可能会导致胃肠道菌群紊乱，引起消化不良，可能会导致腹部疼痛、腹部胀等情况。
小儿便秘的原因有很多，常见有以下几个方面：
第一、如果孩子偏食、厌食、粗纤维丰富的食物摄入减少，粗纤维丰富的水果也吃得不多，容易出现肠道水分少、大便干结便秘，
第二、要重点考虑是否有食物过敏的因素，常见牛奶蛋白过敏、鸡蛋过敏、海鲜类过敏等，过敏可以引起消化功能不好导致大便干结便秘。
第三、部分大一点的还要注意心理方面的因素，特别是上学、幼儿园的常忍住大便，长时间忍住大便可能会导致便秘。
