正常足月出生的新生儿，生后24小时内要接种乙肝疫苗第一针；一个月龄时要接种乙肝疫苗第二针；六个月龄时要接种乙肝疫苗第三针；每次五微克。如果母亲是乙肝病毒携带者，生后六个小时之内要肌内注射高价乙肝免疫球蛋白100-200IU，同时更换部位注射乙肝疫苗10微克。如果母亲乙肝DNA定量阳性，那生后半个月的时候，要重复注射相同剂量的乙肝免疫球蛋白一次。
乙肝疫苗一般打3次，3次间隔0-1-6个月。
若首次注射疫苗时间若2.5，则第2次接种时间为3.5，后3次接种时间为8.5。因为这三个时间段都会影响到乙肝表面抗原抗体水平。因此，关于第3次接种疫苗时机，需综合考虑首次接种时间。一般情况下，要根据实际病情进行判断，如有特殊状况则不允许接种。原则上不应超前，2次接种时间可适当增加，不可能预先接种。
乙肝疫苗第二针在接种一针后28天即可接种，但最晚不能超过60天。乙肝疫苗全程接种三针，免疫程序为0，1，6，即当天注射一针，1个月以后注射第二针，6个月以后注射第三针，一共半年完成全程免疫接种。
第一针和第二针疫苗最晚不要超过48天，接种乙肝疫苗要按照规定的时间接种，不可以提前接种，但可以稍微延后接种，种第一针乙肝疫苗之后可以产生一定的抗体，后面的两针是加强针，间隔的时间太长，不利于乙肝表面抗体的形成。
第三针乙肝疫苗在第二针疫苗接种五个月后接种。乙肝疫苗全程接种三针，免疫程序为0、1、6.即当天接种一针，一个月后注射第二针，六个月后注射第三针。第二针与第一针间隔28天以上即可接种，第三针与第二针间隔3个月以上即可接种。在规定的免疫程序最上限时间不超过1个月都可接种，如果超过最上限1个月后接种可能会影响抗体的产生。
乙型疫苗全程接种按照0，1，6个月程序，即接种第1针疫苗后，间隔1及6个月注射第2及第3针疫苗。新生儿接种乙型肝炎疫苗越早越好，要求在出生后24h内接种，新生儿的接种部位为大腿前部外侧肌肉内，儿童和成人为上臂三角肌中部肌肉内注射，单用乙型肝炎疫苗阻断母婴传播的保护率为87.8%。
