长期吃黑芝麻吃过多会使内分泌紊乱，引发头皮油腻、导致毛皮枯萎、脱落，还有就是油脂太多，容易发胖，容易造成消化不良，因为黑芝麻中的油脂与蛋白质的含量都是比较高的，这两种物质都是比较难以消化的，如果摄入量超过人体所能负担的剂量，油脂和蛋白质在肠胃中堆积，会给人体的消化系统带来负担。
黑芝麻是一种具有补益精血、润肠通便作用的中药。黑芝麻主要用于精血不足引起的须发早白、头晕眼花以及血虚精亏引起的肠燥便秘。现代研究表明黑芝麻具有很强的抗氧化性能，还具有调节脂质代谢、降低胆固醇、保护肝脏、降低血压抗癌等功能。使用方法因人而异，作为调料也可。
食用多了会能使人加速秃头，过多食用造成内分泌紊乱，头皮出油，毛皮枯萎、脱落，有慢性肠炎，食欲不好、大便糖稀人群，不可多吃黑芝麻，黑芝麻不可与鸡肉同食，易导致食物中毒。
孕妇可以吃黑芝麻。黑芝麻具有补肝肾、益精血、润肠燥等功效，其含有蛋白质、氨基酸、矿物质等物质营养成分，孕妇适量食用不但可以补充孕期所需的营养元素，还有利于胎儿的健康发育。但是黑芝麻中含有的油脂较多，可以润肠通便，对于慢性肠炎、腹泻的孕妇应慎吃。
黑芝麻对治疗失眠的帮助一般不大。
黑芝麻治疗失眠一般应与其余食物搭配。例如，核桃加黑芝麻可改善睡眠质量，常用于治疗神经衰弱失眠、健忘多梦等症状。具体吃法是在核桃中加入黑芝麻制成糊状，睡前服用效果非常明显。黑芝麻具有润五脏、益气功效，富含生物素、维生素e，居植物食品之首，含有大量脂肪、卵磷脂、蛋白质、钙、铁等营养成分，起到抗衰老、长寿的作用。
