脑部核磁共振检查没有明确的副作用，因为基本原理是探测人体组织内蕴藏量最丰富的氢离子，在磁共振过程中发出电磁波信号测出氢离子浓度及其驰豫时间，作为成像的参数。
脑部核磁共振没有电离辐射，对人体没有放射性的损害。其中脑部核磁共振是利用人体内氢质子，在磁场中产生共振信号来获得的图像。脑部的核磁共振对颅内的检查能够更精确，同时脑部核磁检查不会出现颅骨的伪影，也不需要造影剂，就能够清楚的显示头部冠状位、矢状位等图像。
肝脏的病变组织血液供应，与正常组织或多或少都有差异，当采用磁共振增强时，需将对比剂注入静脉后，随血液进入病变和正常组织时，由对比剂造成的密度就有高低的差别，从而使平扫不能显示的病变，被很清楚的显示出来了。
费用约在1000元-2000元左右。在临床上头颅磁共振检查主要分为磁共振平扫、脑功能成像以及脑血管成像检查，其中磁共振平扫主要针对既往存在的脑血管病变，以及颅内占位性病变进行检查。
磁共振是一项高端检查，报告通常需要双签名，就是由普通医生书写完成后，由高级医师审核签名后报告才可以发出去。磁共振检查又分为普通平扫和增强检查，普通平扫序列较少，检查时间短，出报告的时间相对也比较短，而增强检查需要注射造影剂，检查时间也延长，通常病情也相对复杂，有的时候需要科室集体读片后发报告。磁共振平扫当天出报告，增强第2天出报告。
磁共振MRI颈椎增强扫描1500元-2000元左右一次，就诊地区及就诊医院等级不同，还有检查仪器差异、以及增强所用药物不同。价位也会有所不同，但这些费用在医保及农合疗的报销范围内。
