进行肛门检查，首先应当选择合适的体位，可选择膝胸位、截石位、弯腰俯卧位，有时也可以采取左侧卧位，选择合适的体位，对检查疾病有很大的帮助。首先应当进行肛门视诊，观察肛门的位置是否有异位变形等。然后观察肛门周围的皮肤及颜色，是否存在着红斑、糜烂、渗出，是否有肿物。
一般查体包括基本检查：身高，体重，血压；内科心肺听诊，外科腹部，乳腺，甲状腺等诊查；骨科，五官科，泌尿科，肛肠科，妇科等专科检查；心电图；影像检查：胸片；超声：肝胆胰脾肾，甲状腺，乳腺，颈部血管等。尿便常规化验，血常规，肝肾功能，血脂血糖的化验，一般男性45岁以上，女性40岁以上查肿瘤标志物。其余检查可根据自身疾病情况及要求增加项目。
有胃痛的症状这样可以及时的去医院做个胃镜的检查，胃镜可以取局部的组织，做个病理检查，就能够确定是不是患有胃癌的症状，平时的时候注意饮食清洁卫生，在饮食上以清淡为主不宜吃辛辣的食物。
检查头部一般是做头部的影像学检查和电生理方面的检查，根据患者的病情不同而选择不同的检查方案。如患者出现头痛，头晕，肢体麻木、无力，可以做头部的CT、磁共振以及脑造影检查。
早期肛瘘通过直肠肛门指检，可以摸到条索状的一个管道、大部分通过目测和直肠肛门指诊即可检查出来，少部分复杂或难以确诊的，做腔内超声或者是肛周超声或核磁共振进行确诊，通过直肠腔内超声，能够发现直肠肛围的脓肿、管道等。
