一般情况下，婴儿先天性心脏病，如房缺型、室缺型、冠状动脉栓塞、肺动脉狭窄等，均能自我康复，但需要长期随访，并进行严密的观察。如有较大的缺陷，可采用介入或外科的方法进行处理。如果有肺动脉阻塞、肺静脉异位引流症、大血管转移等并发症，有可能伴随着体能下降、心力衰竭、出现呼吸道感染、肺动脉阻塞等情况，需要紧急处理。
先天性心脏病的治疗是一个多学科协作的过程，那么对于绝大多数先天性心脏病而言，外科手术是绝对适用的，也就是说外科手术适用绝大多数的先天性心脏病的外科治疗。那么外科治疗目前倾向于微创化，除了外科治疗以外，还有介入治疗。介入治疗主要适用于常见的病情相对简单的先天性心脏病，例如房间隔缺损，简单的部分肌部的室间隔缺损和动脉导管未闭，这些经过介入治疗能够获得很好的疗效。
新生儿有多种先天性心脏病，如有血管导管未闭，应采取外科治疗或介入治疗，避免继发感染性心内膜炎、心力衰竭、肺动脉高压等疾病。如果有明显的症状，可以考虑服用抗心衰药物，在出生后一周内使用消炎痛，也有一些患者需要进行外科治疗。如果要进行介入治疗，可以选用伞状的栓塞。但同时存在肺动脉闭锁、肺动脉狭窄等情况时，应使用前列腺素E2，以保持动脉导管的开通。
先天性心脏病患儿可以使用以下方法治疗，具体分析如下：
先天性心脏病患儿若患有肺动脉瓣狭窄，可采用球囊瓣膜成形术或瓣膜切开术。大部分重度肺动脉瓣窄症均伴有漏斗部分狭窄，而当肺动脉瓣开闭后，漏斗部分肥厚也会随之消失。如果是房间隔缺损，婴儿4岁以下的小面积缺损，也有少数会自动闭合。如果不是闭合或缺损比较大，可以选择手术修复或介入治疗。
老年先天性心脏病可以通过药物治疗、微创手术治疗、外科手术治疗等。
1、药物治疗：通过心脏导管和心脏超声检查，如果病情严重，错过了手术的可能，可以通过药物来提高心脏的功能，从而延长病人的生命。
2、微创手术治疗：对这类病人的病情要谨慎，有冠心病、高血压的病人要谨慎。
3、外科手术治疗：由于手术对人体的要求很高，需要对病人的肺功能、心脏功能、肾脏功能、营养状况等进行全面的检查。
先天性心脏病患者在50岁时出现紫绀就表示先天性心脏病已达到严重程度。在此情况下应及早去医院检查，以明确有无尚有手术指征，并及早进行手术。
先天性心脏病初期，无论房缺或室缺均呈左-右分流状态，即左心血流至右心血流，此时并无明显缺氧现象，病人可表现为不典型症状。病情持续进展时，右心系统受压加重，可出现右心分流至左心系统，此时左心系统血中血氧含量减少，引起周身紫绀出。
