一般情况下，药物流产后流不干净，做清宫手术是会疼的，属于正常的反应。
清宫手术的疼痛感主要是清宫时扩张宫腔带来的，在医疗器械进入宫腔内的刮宫过程也会疼痛，因此药物流产后流不干净，做清宫手术是会疼的。在采用无痛的清宫手术后，麻药药效过后，也会有轻微的疼痛感，但是一般在可以承受的范围内。
日常生活中女性要注意多休息，坚持清淡饮食，不要吃辛辣、刺激的食物，有利于病情的恢复。
清宫手术后7天复查，在做人流手术或分娩后清宫，是需要复查彩超的。是要了解子宫收缩情况，宫腔里是否有组织物残留或宫腔积血。如果复查后都没有异常，就好好休息，恢复身体。
药物流产需要10-14天左右流干净。
女性在怀孕后可以通过药物流产或是人工流产将孕囊排出，如果选择药物流产的话，一般在服药后的第三天就能排出，排出时间在2-3个小时，且在10-14天才能完全流干净。如果在14天后仍然出现出血的情况，需要及时前往医院进行检查，如果宫腔内仍有残留物，需要进行清宫手术将残留物排出，避免出现感染。
一般情况下，药物流产后是否需要立即清宫，要看病人的具体病情。具体分析如下：
通常，药物流产可以口服米索前列醇或米非司酮，在用药后会产生消化道不适、恶心呕吐、腹痛腹泻等副作用。通常使用米索前列醇后，子宫颈的柔软会促使子宫内的排泄。如果孕囊已经全部排出，可以不做清宫。如果孕囊没有完全排出，建议做二次清宫，且需要到正规的医院做个B超，了解自己的恢复状况。
每个医院的费用是不一样的，在三级甲等医院，可能要3000块钱，二级医院应该在2500左右，那么有痛的，应该减半，如果说流产术后没有做干净，需要二次清宫，这种费用就在200块钱左右。清宫术后暂时少吃生冷辛辣刺激的食物，注意局部卫生，避免过度劳累，一个月内暂时禁止性生活，日后做好避孕工作。
流产没有流干净需要查超声等相关检查，以明确残留物的大小。如果残留物较小，可以服用活血化瘀类药物，促进其排出；如果残留物较大，则可以行清宫术，以免其滞留子宫发生激化，造成子宫不规则出血，引发感染，造成盆腔炎、子宫内膜炎或者输卵管炎症等疾病，严重者造成继发不孕。清宫术后应注意休息，避免过度劳累，避免寒凉辛辣刺激性食物，禁止性生活一个月。
