肾囊肿一般大于4厘米才需要处理，肾囊肿相当于肾脏上面长了一个水泡，当肾囊肿大于4厘米的时候，建议可以到医院选择手术治疗。比较常用的手术方式是腹腔镜下肾囊肿去顶减压术，这种手术方式属于微创手术，主要是将肾囊肿的顶壁去除，然后将里面的囊液引流出来。
胎儿肾囊肿无需进行治疗。
因为胎儿肾囊肿的发病原因，与遗传因素或者先天发育异常有关。绝大多数的囊肿都属于良性病变，生长速度非常缓慢。单发的肾囊肿，对于胎儿的身体健康以及出生后的身体健康，都没有明显的不良影响，通常是不需要进行特殊治疗的。如果囊肿体积增大，可以进行手术治疗或穿刺抽液治疗。但如果对胎儿的身体较大时，应选择终止妊娠。
在B超的引导之下穿刺引流，把囊肿的液体吸出来，然后往里面打一种无水酒精，叫做硬化这种方法。用腹腔镜在腰上打上2-3个眼，把这个手术完成，病人基本上没有太大的痛苦，手术恢复也非常快。
如果直径大于5cm或者伴有明显的腰区胀痛、坠胀等，可以治疗。现在多采用经腹腔镜囊肿去顶术，手术创伤小，恢复快，效果好。也可以采用彩超引导下囊肿穿刺抽液，注入硬化剂治疗，但复发的机会比较大，现在常常用于不能耐受手术，年龄比较大，体弱者。肾囊肿药物治疗是无效的。如果肾囊肿伴有钙化，更应该及时到泌尿外科就诊。
肾囊肿穿刺硬化治疗是治疗肾囊肿的一种比较好的方法，它就是在b超的引导下，经皮肾穿刺进入囊腔内，将囊腔内的液体抽出，然后按照一定的比例将95%的无水酒精或者其他的硬化剂注入囊壁内，通过充分的灌洗将肾囊肿的囊壁黏膜进行破坏，减少囊壁的分泌功能，通过这种治疗可以减轻囊肿的进度，可以使囊肿缩小，囊肿的分泌功能减退，从而抑制囊肿进一步的增大，达到治疗效果。
价格在3000-5000元左右，肾囊肿的治疗一般根据肾囊肿的体积来判断，小于四个厘米的囊肿不需要处理，大于五公分考虑的治疗，用肾脏穿刺硬化治疗，而对于凸出于肾表面的囊肿，腹腔镜肾囊肿去顶减压。
