如果卵巢巧克力囊肿直径小于六厘米，可以暂时不予治疗，但是要按时复查，防止进一步变大。重要的是做好计划生育，减少流产次数。当大于六厘米就需要考虑手术来治疗了。没有达到手术指征的时候，可以通过中医的方法进行治疗。
一般手术后2个月内复查。如果你想检查卵巢囊肿，通常在月经干净后通过b超检查。与上一个结果相比，是否有渐进增长？如果典型的卵巢子宫内膜异位症囊肿可以通过病史、妇科检查结合B超诊断，但这不是金标准。其实有些“卵巢子宫内膜异位囊肿”的诊断比较困难，甚至需要腹腔镜诊断。回顾一些b超检查，避免性生活。有一个适当的休息。
手术后2个月内复查。如果你想检查卵巢囊肿，通常在月经干净后通过b超检查。与上一个结果相比，是否有渐进增长。如果典型的卵巢子宫内膜异位症囊肿可以通过病史、妇科检查结合B超诊断，但这不是金标准。其实有些卵巢子宫内膜异位囊肿的诊断比较困难，甚至需要腹腔镜诊断。
巧克力囊肿腹腔镜手术最佳时间并没有明确要求，需要根据患者的情况来分析。
巧克力囊肿的手术时机并不是很确定，要根据患者的具体病情来决定。卵巢巧克力囊肿最好避开经期进行手术当然，女性在月经结束后3-7日是手术比较好的时间。女性月经来潮后3-7日需要进行输卵管和子宫的检查。如果伴有卵巢朱古氏囊肿，需要进行子宫内窥镜下的子宫不育和双侧输卵管畅通的检测。
可以用一些药物进行治疗，出现痛经，考虑跟巧克力囊肿有关系，在医生指导下用一些药物进行调理，具体能否治好，现在还不能确定。建议在医生指导下进行调理，平时在生活方面也要注意多喝水，多吃青菜，少吃生冷辛辣的食物，注意腹部的保暖，三餐要规律，定期做好复查。
观察流血的量及持续的时间，如果量少，持续个三四天会自止。如果量多似月经量，持续时间也似经期，那就是月经来了。注意保暖及外阴卫生就行。这种暂时性的变化一般不会持续太久的，一两个周期后就能恢复正常。
