巧克力囊肿腹腔镜手术最佳时间并没有明确要求，需要根据患者的情况来分析。
巧克力囊肿的手术时机并不是很确定，要根据患者的具体病情来决定。卵巢巧克力囊肿最好避开经期进行手术当然，女性在月经结束后3-7日是手术比较好的时间。女性月经来潮后3-7日需要进行输卵管和子宫的检查。如果伴有卵巢朱古氏囊肿，需要进行子宫内窥镜下的子宫不育和双侧输卵管畅通的检测。
巧克力囊肿一般指的是子宫内膜异位囊肿。通常情况下，患者做完子宫内膜异位囊肿腹腔镜手术后，1-2周左右就能恢复。具体情况分析如下：
子宫内膜异位囊肿是指卵巢内的异位子宫内膜组织周期性反复出血，由于腹腔镜是创伤小、恢复快的微创外科技术，患者做完手术后，一般恢复时间较短，一般一般1-2周左右就能恢复，可以继续工作和生活。
巧克力囊肿腹腔镜手术属于子宫内膜异位症，临床上往往会出现痛经，出血量多以及出血是正常的情况，是需要做手术进行切除的，手术后最少要休息两周，一定要多注意保暖以及个人卫生，手术后还有可能会有复发的情况，所以要定期的进行检查。
巧克力囊肿在腹腔镜手术中出现了创痛的症状，需要在医生的指导下进行治疗。
1、腹腔镜下的腹壁穿孔疼痛，一般是因为穿刺孔伤和病人的血管引起的皮下血肿，或者是在穿过肌肉的过程中，会对肌肉造成轻微的伤害。
2、巧克力囊肿术后会出现轻微的疼痛，但随着时间的推移，这种疼痛会慢慢消失。
3、术后出现持续的腹部疼痛，要考虑是不是手术效果不理想导致的，要考虑是不是手术后出血，还是巧克力囊肿的特殊性，以及手术中有没有损伤到其他器官，例如输尿管、肠道等。
所以，手术后术区的疼痛，一定要仔细的分析，找出原因，然后再进行治疗。
囊肿都是一个良性的疾病，一般不需要特殊的治疗，定期复查就可以了，超过五厘米的情况下，才建议手术治疗，手术可以采用微创手术，微创手术的治疗效果好，创伤小，恢复快等优点。
巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种表现形式。做完巧克力囊肿手术一般需要5天的时间就可以拆线，一个月的时间就能够恢复。术后之后至少半年的时间才可以怀孕的，避免怀孕过早，增大的子宫引起了腹腔刀口破裂的可能。