手术方法取决于病因的性质，例如先天性肾盂输尿管连接部狭窄可作肾盂成型术，肾、输尿管结石可行碎石或取石术，这些手术近年可用内腔镜进行。术后肾积水及肾功能会有所改善。
小儿先天肾积水一般不会影响性功能。
先天肾积水是指在胚胎阶段出现的肾脏聚集体系的异常扩展，如果在24周以前，聚集体系分开大于0.5cm,24周以后，或者是新生儿阶段分开1厘米以上，则是属于先天肾积水。男性的性功能主要是因为性腺分泌的荷尔蒙保持了第二性征，所以肾积水只是因为肾和输尿管的构造有问题，不会对性腺造成任何的伤害，所以不会对性荷尔蒙和性功能造成一定的损害。
肾结石伴肾积水，有尿路感染时会出现发烧，但没有泌尿系统感染，仅为肾脏积水，一般不会发烧。肾结石是一种身体的杂质，所以在泌尿系统中，如果出现了尿液混浊和沉淀，通常会伴有泌尿系炎症，所以要多饮水，多排尿，如果出现了明显的症状，可以暂且静养，如果尿常规是三个以上，甚至四个以上，就是出现了严重的泌尿系感染，为了避免出现脓毒血症，应给予相应的抗生素。此时饮食应选择易消化，富含热量、维生素、蛋白质的食物，如鸡蛋羹、水果等。
肾积水对性功能有影响，病人被诊断为肾积水。引起肾积水的常见因素包括结石梗阻、肿瘤梗阻和压迫、先天性尿路畸形等。改善血常规、生化全套、尿常规、尿彩色多普勒超声甚至尿路造影等辅助检查，了解原因明确诊断和治疗。如果肾脏长期严重积水会对肾功能造成损害，还可能发生腰痛和发烧等感染，从而导致性功能障碍。
肾结石的早期如果不堵塞输尿管、肾盂和肾脏，则不会导致肾积水，同时也不会出现腰痛、腰胀等症状。如果结石的体积越来越大，结石的位置也会发生变化，一旦跌入尿道，如肾盂，输尿管等，就会出现阻塞。
肾结石是由肾盂输尿管排出的，如果肾结石落在肾盂输尿管上，在此滞留，就会导致肾积水。如果患者出现肾积水的情况，建议导致泌尿外科就诊，进行针对性治疗，以免进一步损害身体健康。
肾结石可能会有肾积水，但也可能没有肾积水，具体分析如下：
肾结石有很大的几率会出现肾积水。肾积水主要是因为肾结石导致的泌尿系统阻塞，导致肾脏排泄不畅。肾脏结石、肾积水可以通过彩超、CT等相关检查来确诊。如果是轻度的肾积水，可以马上进行治疗。肾积水严重，对肾功能有很大影响，可以先排出尿液，再做其他治疗。
