一般来说，如果是因为感染了大肠埃希氏菌引起的，一般需要按照药物过敏实验来选用最灵敏的抗生素。头孢噻肟、头孢曲松、头孢吡肟等3、4代头孢霉素，或亚胺培南，美罗培南，比阿培南，帕尼培南，厄他培南等药物敏感试验。在药物敏感性测试的基础上，根据药物敏感性测试的情况，决定使用最灵敏的抗菌药物。抗生素的疗程与感染的严重性和病人的基本病症有关。一般是2个星期，如果情况比较严重，可以延长治疗时间，一般用到患者的身体温度和体征消失后5-10天。
孩子大肠杆菌的败血症的治疗主要是使用敏感抗生素抗感染治疗，必要时需要使用增强免疫的药物治疗，严重的可换血治疗。抗生素的选择至关重要，要在入院时要进行血细菌培养和药敏试验。
肠杆菌感染所致的败血症是寒战高热和大肠杆菌感染败血症有毒血症状，并可发生中毒性脑病、感染中毒性精神病。还有消化道症状，严重者会有休克。注意继续使用抗生素来进行治疗，避风寒，勿劳累。
婴儿败血症通常是进奶次数减少或拒乳、嗜睡、烦躁等症状。
新生儿败血症的早期临床症状通常是不典型的，特别是在早产儿身上。婴儿败血症主要表现为进奶次数减少或拒乳、嗜睡、烦躁、哭声低、发热或体温不升高等，还可以出现体温正常、反应迟钝、面色苍白或灰暗、精神萎靡、体重不增等。婴儿败血症可以分为早发型和晚发型两种。如果败血症比较严重，可能出现循环系统的表现，比如休克、四肢厥冷等改变。
儿童败血症是可以治好的。
要对症治疗，注意卧床休息，补充营养和适量维生素，保持水和电解质、酸碱平衡，必要时输血、白蛋白、血浆、丙种球蛋白。高热时可以物理降温，烦躁的用镇静剂等。治疗病原后及时用抗菌药物治疗，早期、足量，以杀菌剂为主。两种抗菌药物联合用药，一般是静脉注射，首次注射剂量要大，药物半衰期要分次给药，疗程要长，3周以上或退热后7-10天方酌情停药。
