要积极配合医生治疗，首先要消除症状，强调早期治疗早期病变是可逆的改善全身症状，可以促进病灶愈合。可以采用抗结核药物治疗，同时多注意休息，可以增强自身体质或者抵抗力，多吃新鲜水果蔬菜等。
肠结核狭窄，腹痛可给予抗胆碱药或其他解痉药。伴有不完全性肠梗阻者，给予胃肠减压以减轻梗阻近端肠管的扩张与潜留。完全性肠梗阻，肠道大量出血经积极内科治疗仍未能满意止血者需要手术治疗。
肠结核阳性尽快去传染病医院进行抗结核治疗的。感染的可能性也相对较高。仍然需要隔离治疗。肠结核为消化系统结核中最常见者。绝大多数继发于肠外结核病，特别是空洞型肺结核。
肠结核的复查检查需要做肠镜，但是做肠镜要看病人的身体状况，有些身体情况不宜做肠镜，尤其是在肠结核疾病治好后，很容易发生肠粘连或者倡导狭窄，不是特别适合再做肠镜，否则容易产生损伤，加重肠粘连，可以做CT检查。
骨结核一般需要一年半左右的时间才能治愈。骨结核的治疗过程比较长，通常分为脊柱结核、大关节结核、关节结核。关节结核在手术之前需要进行1~2个月的抗结核治疗，大关节结核要进行1个月的抗结核治疗，小关节结核需要进行2个月的抗结核治疗。抗结核治疗后要进行外科手术，一般是脊柱结核和大关节结核，一年到一年半的时间。这段时间，前半年一个月一次，半年后三个月一次。在不完全的骨骼变化的情况下，是可以被治疗的。
