念珠菌感染需要选择抗真菌药物，因为念珠菌也就是真菌的一种，要想用药，需要去医院先检查肝功能抽血，然后再判断使用的药物剂量。在用药期间，也需要复查肝功能，以免影响，如果有出现肝功能损伤，需要考虑停药的。
局部用药，用于部分皮肤和粘膜念珠菌病，全身用药用于局部用药无效的皮肤粘膜念珠菌病，以及部分粘膜系统性念珠菌病的治疗。药物选择，由于耐药菌株的不断增加，应根据真菌的药物敏感实验来选择药物，在经验性治疗中对于皮肤粘膜念珠菌病，通常使用吡咯类药物，相对安全有效；而对于侵袭性念珠菌病，两性霉素B和吡咯类药物均可采用，但如果是重症感染或重要部位非白念珠菌感染，则两性霉素B优先考虑，待药敏结果出来后再做调整。
念珠菌性阴道炎也称霉菌性阴道炎症。常表现为阴道瘙痒，白带呈豆腐渣样改变。因为念珠菌性阴道炎症容易反复发作。治疗上，必须按照疗程系统治疗。治疗期间严禁性生活，可以夫妻同治。
如口腔、外阴、阴道白色念珠菌感染等的治疗：轻者以局部治疗为主，重者考虑全身治疗。口腔感染治疗通常使冲洗及含漱的基础上给予外用药，疗程一般为7～10日。念珠菌感染无性别差别，可累及任何年龄组，包括未出生的胎儿，感染可侵犯人体几乎所有的组织和器官。累及多个系统或脏器成播散性念珠菌病，包括念珠菌血流感染。
念球菌阴道炎常表现为瘙痒难忍等症状，其危害极大。影响性生活质量，患上霉菌性阴道炎以后，会有外阴部痒，白带增加等，影响夫妻二人的正常生活。还会造成不孕：霉菌感染不可能短时段内威胁到妊娠，仅有破坏了宫颈的正常功能后才会妨碍到受孕过程。
念珠菌感染治疗原则是消除诱因，同时用抗真菌的药物治疗。首先消除诱因，比如停用广谱抗生素，积极治疗糖尿病，不要穿过紧的裤子，注意性生活卫生，勤换内裤，用过的内裤，盆或者毛巾，用开水烫洗。其次药物治疗，有全身用药和局部用药。
