如果是在乙肝病毒DNA转阴性之后，患者一般不能擅自停药，以免影响病情的控制。
目前对乙肝的抗病毒治疗主要是采用高效力、低耐药性的抗病毒药物，大多数病人服用3-6个月之后，会发现HBVDNA会发生转阴性，但是如果停药，可能会引起HBV的再次发作，也有少部分病人会有严重的肝炎症状，在医生的建议下进行治疗和停药。目前慢性乙型肝炎可以服用4年或更多的抗病毒药物，长期服用可以降低复发，少数病人推荐终生服用。
丙肝病毒转阴后是会复发的，丙肝感染要查丙肝病毒RNA，如果高灵敏肝病毒RNA阴性，那么就说明已经治好的。治疗以后大部分都能恢复，但是有少部分人会出现反弹，应该及时复查。
乙肝病毒携带者指的是乙肝表面抗原阳性。如果检查乙肝五项提示乙肝表面抗原是阳性的，说明已经感染了乙肝病毒。乙肝病毒携带者其实也是感染了乙肝病毒，与乙肝感染者只是相对的，只能说明病毒可能处于繁殖的抑制期，并不是太活跃。所以，目前临床上还没有可以完全清除乙肝病毒的药物，还有乙肝表面抗原是无法转阴的。
在部分乙肝携带者中，如乙肝表面抗原极低，病毒低于检测下线，随着年份的增加看，有自发转阴的情况，也有经过干扰素治疗后转阴的。肝携带者需定期复查腹部彩超、乙肝DNA、乙肝五项、肝功能、甲胎蛋白，需注意休息，勿熬夜、劳累、饮酒等。如肝功能反复异常，则可能要抗病毒。
不一定，乙肝病毒携带者，说明感染了乙肝病毒，目前没有特效药物和方法根治慢性乙肝，不过，在对症的中医中药或西药治疗下，是可以达到肝功能正常且病毒量阴性的目标。不过，也有自然转阴的个例。
