主要还是去检查过后根据医学方面的方法去治疗。低位脓肿-直接切开。马蹄脓肿-切开加旷置。高位脓肿-挂线术。高位脓肿-等压引流术。由于切割挂线依然切断了肛直环，痛苦大，创口深。为了进一步降低手术创伤，可以采取双向等压引流手术治疗。
急性肛周脓肿主要是由于肛门局部炎症性感染导致，其源头主要在肛管内的肛隐窝处，主要发生于慢性腹泻或者是肛窦急性感染期。确诊后需要尽快进行肛周脓肿切开引流术或者肛周脓肿一次性根治术的手术治疗。
肛周脓肿形成的原因多数是由于肛窦炎感染未得到及时控制，而波及到肛门直肠周围软组织，从而形成局限性脓肿。肛窦一旦感染后，会引起肛门腺感染化脓，炎症向肛周间隙内扩散形成肛周脓肿。
肛周脓肿可以做收缩肛门的运动，也叫提肛运动。肛周脓肿手术后头几天还是要尽量少运动，多卧床休息。这种运动对于卧床，久坐的白领，久站的劳工等都有好处，平时要注意卫生。
可在切开脓肿后，用探针仔细检查内口，然后切开瘘管，适当切除皮肤和皮下组织，内口周围组织也稍加切除，使引流通畅。如内口较深，瘘管通过肛管括约肌，可采用挂线疗法。以上手术优点是脓肿一期治好，不再形成肛瘘。但在急性炎症中，找内口有困难时，不应盲目寻找，以免炎症蔓延或形成假道，仅做切开排脓，待形成肛瘘后，再做肛瘘手术。二期手术优点是效果准确，治好的可能性高。
