婴儿肛周脓肿可能是激素水平过高、肛门腺体数量较多、肛窦炎等原因引起的。
1.激素水平过高：婴儿患肛周脓肿的高峰期是出生后1-2个月，男宝宝患肛周脓肿的概率更高，出生3个月内的男宝宝睾酮水平较高。
2.肛门腺体数量较多：肛门腺体可分泌粘液，润滑直肠。孕期母体内雌激素水平升高，可使婴儿肛门腺体数量增多，大便次数较多。排便时细菌性稀便进入腺体，可引起感染，出现肛周脓肿。
3.肛窦炎：患儿肛门括约肌收缩时，体内炎性分泌物排泄受到影响，扩散至直肠、肛门周围时，就可能形成肛周脓肿。
肛周脓肿是由于肛腺感染引起的，由于肛窦开口向上，像口袋一样，可以存留粪便，容易引起肛窦发炎，感染蔓延至肛腺后导致括约肌的肌间感染，从而引起各种类型的肛周脓肿。需要到医院就诊。
肛周脓肿形成的原因多数是由于肛窦炎感染未得到及时控制，而波及到肛门直肠周围软组织，从而形成局限性脓肿。肛窦一旦感染后，会引起肛门腺感染化脓，炎症向肛周间隙内扩散形成肛周脓肿。
小儿肛周脓肿的原因主要为出现肛隐窝细菌感染，或者是便秘引起的。
小儿肛周脓肿可能是因为小儿的身体还处于发育期，肛隐窝尚没有发育完善，大便或者细菌进入肛隐窝以后，返回的可能性很小，造成肿胀。如果小儿经常出现便秘，或者稀便的情况，因为小儿的身体抵抗力较低，大便或者肠液物质容易在肛周反复摩擦，滋生细菌，引起肛周脓肿的情况。
急性肛周脓肿主要是由于肛门局部炎症性感染导致，其源头主要在肛管内的肛隐窝处，主要发生于慢性腹泻或者是肛窦急性感染期。确诊后需要尽快进行肛周脓肿切开引流术或者肛周脓肿一次性根治术的手术治疗。