肾脓肿主要是抗炎治疗，必要时手术治疗或引流手术治疗，抗炎口服药物，配合治疗。个体差异的不同，每个人治疗后的效果也不同，如病情没有大的起色，还需及时的去医院再次诊治，让医生依据病情，及时的调换药物，使病情得到合理的治疗，从而减轻不良症状。
医好肾脓肿在1万-3万元左右，根据不同的医院，收费标准不一样，患者的病情不一样，治疗方法也是会有差别的。脏囊肿如果有明显的这种临床表现，是要进行手术治疗的，现在基本上都是经皮肾镜的一种微创手术治疗，治疗的费用大概在3万元。建议患者到专业的泌尿外科进行诊断，在医生的指导下才能选择不同的治疗方式。
肾脓肿治疗主要是脓液引流及抗炎输液控制感染治疗。如果合并糖尿病应该积极控制血糖，否则患者有感染性休克甚至死亡的可能。脓液引流可根据脓肿的大小，采取经皮肾穿刺引流和手术切开引流。也可以根据细菌培养结果使用敏感的抗菌素。
肾脓肿首先表现是患侧肾区的疼痛，高热，通过彩超或者CT可以发现肾脏周围的间隙不清，腰大肌的轮廓模糊，抽血化验血象可以明显的升高，这种种征象可以提示肾脓肿。肾脓肿的处理方案，首先是做肾脏的穿刺造瘘引流，只有通过引流通畅，肾脏里面内部压力减低，这样才可以有效的控制症状。另外要做脓液的培养，积极的抗炎，补液处理。
肾囊肿一般伴有肾功能损害有不同程度的贫血，为全身表现，腰痛，慢性病人患侧腰部明显压痛及叩击痛，腰部可扪及肿块。患者中期表现在腰痛、肾区有包块、尿液中大量脓细胞、血中白细胞明显增高。
可用中医治疗，采用微化中药渗透疗法，该疗法的中药活性物质促使囊壁上的血液循环与通透性发生质的改变，从而使得囊内液不断回收，不断减少，直至不再分泌；腹腔镜肾囊肿去顶减压治疗，分为腹腔入路和后腹腔入路，创伤小，恢复快，减压彻底。