巨细胞病毒感染，可应用各种抗病毒制剂如GCV、抗巨细胞病毒的免疫球蛋白制剂、干扰素及转移因子等来治疗，在治疗之后也要注意预防。平时也要注意有意识的身体素质的锻炼，提高机体免疫力，预防病毒感染，要注意卫生环境，饮食环境，饮食方面建议以清淡营养为主。
新生儿巨细胞病毒感染，需要处理及时，效果好，亦不免有后遗症，因此，防范尤为重要。
目前，我国有很多传染病已得到了很好的防治和控制，但仍存在许多潜在问题。考虑到传染的广泛性，多为隐性的，传播途径比较复杂，也不可控，加上易感染的广泛存在。因此要防止疾病发生和流行，首先必须采取综合防治措施。预防措施主要集中在研制疫苗上，做自觉身体素质练习，增强机体的免疫能力，同时增强抗病能力，尤其对育龄期的女性来说，为了减轻病毒、巨细胞病毒给胎儿带来的严重危害。
妊娠合并巨细胞病毒感染通常主要使用抗病毒药物治疗。
感染后建议去正规三甲医院就诊，在医生指导下使用对胎儿影响小的药物，一般最少需要治疗3-6个月，治疗期间定期复查指标，如果结果显示阳性要继续治疗。为防止用药影响胎儿发育，要做好产前检查，尤其16-20周的唐氏筛查和22-26周的四维彩超排畸检查，如果出现异常情况，根据医生建议终止妊娠。
注意均衡营养饮食，保持心情舒畅。
感染后可以没有症状，有的则可以有发热，出现严重的肝功异常，肝脾肿大等症状的，需要做血常规，肝功能，肾功能等检查来判断的，根据这些检查结果来判断病情，好做进一步治疗的，可以配合用阿昔洛韦等药物做抗病毒的。
婴儿巨细胞病毒感染可能会好。
婴儿巨细胞病毒感染较为严重，致死率高，除流产、死产外，感染胎儿往往会导致胎儿先天畸形。在出生后，病情较重的人会在几天或几个星期之内死去；90%的生还者留下了诸如发育迟缓，智力障碍，运动障碍，癫痫，视力下降，听力障碍等。
因此，该病的防治工作尤其重要，由于传染源广泛，且多为隐性，其传播方式复杂，难以控制，并且易感普遍，因此防治工作的重点是疫苗的研制。
一般来讲，巨细胞病毒感染的严重性与年龄、免疫功能状态有关。一般来说，年纪越小，病情越严重，年纪越大，病情也就越轻。巨细胞病毒的感染对一般人的影响很小，而且没有太大的症状。对胎儿和免疫系统缺陷患者有很大的影响。对宫内胎儿会造成严重的神经系统损害，造成耳聋、智力障碍、运动障碍等，严重的还会导致残疾、死亡。免疫力低下的人，会出现各种严重的症状，如肺炎、视网膜炎、脑部病变等。
