脑炎的鉴别诊断主要有以下三个方面：
1、临床表现：头痛、发热、恶心、呕吐、神经功能缺损，神经功能缺损主要表现为意识障碍、言语思维障碍、乱喊乱叫等；
2、体征：精神状况、神经反应、神经反应、神经反应等；
3、辅助检查：脑电图、腰椎穿刺、核磁共振等辅助性检查，可以根据脑脊液检查或其他检查来确诊脑炎的种类，并进行针对性的处理。
病情较轻时，可以通过改变饮食习惯，病情较重时，通过吃药来控制病情，但是用药要分步骤进行。
儿童脑炎早期会出现感冒症状、精神行为异常，婴幼儿则表现为不肯吃奶、头痛，经过的感冒治疗无效后应及时排除脑炎的，脑炎早期症状跟感冒差不多，病人会发热、全身酸痛、食欲差，随着病情发展，会出现嗜睡、兴奋、抽搐神经系统的表现。
脑炎的患者的诊断一般来说是需要结合患者的病史、相应的体格检查和辅助检查才可以确诊。
发热、头痛、癫痫发作、肢体的活动障碍、肢体的某些癫痫，尤其是局灶性的癫痫发作、反应迟钝、认知行为异常、共济失调等症状的患者，在发病前可能有感冒、受凉的病史，通过辅助检查可以发现病灶，腰椎穿刺脑脊液检查也能发现相应的抗体阳性和生化异常。脑炎的诊断要结合自身免疫性疾病、局灶性癫痫发作、自身免疫性疾病引起的中枢神经系统的病变、血管性疾病、肢体活动障碍等疾病的鉴别诊断。
大部分的脑炎后遗症几乎都有发热，头痛，神经受损及脑膜刺激征共同的表现，一般患者都需要脑脊液的检查。如果是病毒性脑膜炎的话，脑脊液的检查为蛋白含量轻度增高，糖和氯化物含量正常；如果是化脓性脑膜炎的话，脑脊液中白细胞数较高。
脑炎头颅磁共振在影像学上可能会有反应，要想对脑炎进行诊断，我们主要是做腰椎穿刺，然后送脑脊液的生化常规检查。看看脑脊液的细胞数来确定是否有炎症。脑炎其实就是颅内的炎症反应，脑炎的症状，主要有发烧，头痛，恶心呕吐，还有就是颈项强直。
