都是属于抗病毒类的口服药。这两种口服药的主要区别是，前者用于带状疱疹和水痘或者是单纯疱疹，后者除了使用于带状疱疹或者是单纯疱疹以外，也可以用于一些免疫力下降或者是其他病毒类感染的疾病，用于艾滋病导致的免疫严重受损伴发的病毒感染。
该药1适用于免疫受损患者无致命危险的带状疱疹、单纯性疱疹病毒皮肤粘膜感染，以及早期生殖器疱疹病毒感染。而该药2是对单纯性疱疹病毒、水痘带状疱疹病毒、巨细胞病毒等具有抑制作用。
主要是一个两个抗病毒药物的区别问题，这两个抗病毒药物是没有太大区别的，主要是一个分子式的相关区别。如果有病毒感染，使用这两个药物其中一种都是可以治疗的，同时需要增强机体的抵抗力才行。
阿昔洛韦临床上主要用于病毒引起的感染，如单纯疱疹、带状疱疹等，也可用于皮肤、黏膜感染等引起的单纯疱疹病毒感染，预防免疫缺陷疾病的发生。喷昔洛韦用于严重带状疱疹患者，如出血性带状疱疹，坏疽性带状疱疹，播散性带状疱疹，三叉神经支带状疱疹，带状疱疹脑膜炎、严重疼痛的早期带状疱疹等和免疫机能障碍并发的带状疱疹。
前者最常用于治疗水痘带状疱疹及Ⅰ型、Ⅱ型单纯疱疹病毒感染。该药物到达体内之后可迅速转化为阿昔洛韦，再进入到被感染的细胞当中，从而抑制病毒DNA的合成，终止病毒的复制，从而达到抗病毒作用。后者常用于带状疱疹和原发性生殖器疱疹。该药物在进入人体的消化道后会接受消化道给予的刺激，转变为有活性，有治疗效果的喷昔洛韦，然后渗透进入受到了病毒感染的细胞内部，对DNA的合成以及遗传信息的传递进行抑制。
利巴韦林和阿昔洛韦相比较之下阿昔洛韦效果要比利巴韦林要好，如果病毒感染得不厉害没必要用阿昔洛韦，因为目前国内外没有杀病毒的药物，都是抗病毒的药物，建议最好根据感染病毒的类型来选择有效的抗病毒药物。
