不同病因的腮腺炎在临床的治疗方法不同，腮腺炎大多由金黄色葡萄球菌或链球菌感染引起，腮腺局部红肿热痛，挤压腮腺导管口有脓液溢出。其治疗上主要以抗病菌类的药物治疗。
成人腮腺炎应用抗菌药物静脉滴注，高热等全身症状显著可以短期内使用糖皮质激素。流行性腮腺炎需要积极抗病毒治疗，口服或者肌注抗病毒药物，同时需要传染病隔离两周。
针对较小的腮腺结石，可采用保守方法进行治疗，可以食用一些酸性的食物，从而能促进唾液的分泌，利于结石的自行排出，如果结石过大的话，一般无法自行地排出，此时应当采用手术方法切开取石了，术后对于病人的护理要格外注意，且要注意饮食的调整。
腮腺癌治疗主要是手术切除为主。如果是肿瘤，已经侵犯周围组织或者是切除不彻底，需要考虑辅助适度放疗。腮腺癌由于位置比较表浅，一般表现为耳垂下面逐渐增大的结节，比较容易发现，所以一般能够早期诊断，及时手术切除，治疗率非常高。关键是早期发现，及时确诊，及时治疗。
得了良性腮腺瘤一般以手术治疗为主。
腮腺混合瘤以中年居多。一般无明显症状，如无痛感、瘙痒等症状，生长缓慢，病程长达数年甚至数十年，因此患者往往不被重视。虽然腮腺混合瘤是良性的，但也会发生恶性病变。腮腺混合瘤的治疗原则是彻底手术切除。意见建议：腮腺混合瘤目前尚无特效药物治疗，主要采用手术治疗。早期腮腺肿瘤应及时、规范地手术，以避免恶变。
慢性腮腺炎也称腮腺管炎。大部分是由于导管结石或者是异物阻塞形成的，男性多于女性，可能和进食有关系，稍微按摩后可有咸味液体流出。治疗以去除病因为主。可以在导管内注入药物，比如碘化油或者是抗生素，有一定的抑菌和抗菌左右。也可以按摩腮腺，促使分泌物排出。也可以咀嚼口腔糖或者是维生素片，促进唾液腺分泌。