如果恶性肿瘤一般不会缩小，只会越长越大的。如果囊肿透声比较差，或者是囊实性的肿物，或者是肿瘤标志物数值偏高的情况下，是要选择手术治疗的，因为这就不是单纯的囊肿了。
卵巢生理性囊肿不超过4cm，如果彩超检查发现存在囊肿是需要给予对症治疗的，对于囊肿比较大，疼痛明显的情况，一般是需要手术治疗的，对于小囊肿，肿瘤标志物是正常的，可以定期复查。
良性卵巢肿瘤，要切除患侧卵巢肿瘤，手术时一定要检查对侧的卵巢情况，如果对侧也有肿瘤则必须切除，同时做病理检查.但术后易复发.恶性肿瘤者：手术是首选方法，其手术范围要广，一般都切除全子宫，双附件加大网膜.手术后还须进行化疗、放疗。
巧克力囊肿没有生理性的。是子宫内膜异位症的结果，有两种可能：1.不是巧克力囊肿；2.是巧克力囊肿。不论是不是巧克力囊肿，由于手术直接将囊肿切除了，病灶全部切掉了，自然就没事了。如果有残留的病灶存在，就很可能还会复发。
卵巢囊肿术后复发是很常见的现象，往往因其他疾病就医在行妇科检查时才被发现，以后随着肿瘤的生长，有所感觉，其症状与体征因肿瘤的性质，大小，发展，有无继发变性或并发症而不同。其治疗方法也是根据病因制定才有明显效果，切勿盲目治疗。
卵巢囊肿一般体积大于四五公分以上，同时伴有疼痛，腰酸，肚子坠胀不舒服的情况应该手术。目前卵巢囊肿的手术分为两种方式，一种是开腹传统的手术，还有一种是目前需要腹腔镜下做的，相对来说腹腔镜属于微创，是不需要开刀，只需要在肚子上打几个小眼就可以做了。
