轻微肛周脓肿需要治疗一至两周左右的。可以理疗、外敷中药或用抗生素作局部注射等方法来进行治疗，也可以每天使用温水在温水中加入生理性质的盐水进行坐浴的治疗，来缓解轻微肛周脓肿的情况。
肛周脓肿这就是局部有细菌感染，有炎症造成的。需要吃点消炎药的，可以每天用热的淡盐水肛门坐浴熏洗10分钟，来预防感染的发生及促进创面，保持大便通畅，不要干燥和腹泻，禁止吃一些辛辣刺激的，酒，海鲜类的食物。
婴儿肛周脓肿自愈几率比较小，经过积极治疗后，一般3-6周能痊愈，具体分析如下：
婴儿肛周囊肿多表现为肛周肿胀、疼痛等症状，肛周脓肿一般不能自愈，通常需要及时去医院进行检查，并进行针对性治疗，积极进行治疗以后，3-6周能痊愈。林外，切开引流是肛周囊肿的首要治疗方法，通过手术进行彻底清理，加上抗感染药物配合，3-6周可以治愈。
传统的手术治疗比较麻烦，通常需要进行两次手术，第一部分是化脓清除，并在一段时间后当脓液破裂形成肛瘘，然后做肛瘘手术。更严重的脓肿腔破裂后会形成的复杂肛瘘，很难准确地发现脓的来源，这不仅治疗并不完整，但也对病人带来巨大的痛苦。需要1-3个月的恢复时间，复发率较高。
治疗肛周脓肿需要手术，手术时间一般半个小时以内，加上麻醉等时间，从进手术室到出手术室一般一个小时左右。肛周脓肿手术过程不复杂，包括脓肿切开、寻找内口、切除或挂线等过程，这些过程所花时间都不多。