肛瘘的症状是会排脓，脓汁粘稠，黄色、味臭；瘘管日久的排脓相对较少，或时有时无，稀淡如水；若脓量增加，则表示新瘘管生成瘘管有时会暂时封闭，不排脓液，从而出现局部肿痛，体温上升。
中医治疗肛瘘需要吃一些相关药物进行治疗，同时在平时生活中要注意个人卫生，养成良好的生活习惯，少吃辣以及油腻的食物，注意清淡饮食，避免熬夜劳累。必要时可以到医院检查一下。
肛瘘一般是由于肛周脓肿引起脓肿自行破溃，形成肛瘘，一般药物治疗的效果不是很好，必须手术治疗。肛瘘也属于肛肠科疾病一般可以对症治疗，术后尽量要多休息，不要有太过剧烈的运动。
按病变程度分类：单纯性肛瘘，只有一条瘘管，内外口直通的肛瘘；复杂性肛瘘，瘘管和外口在两条或两个以上，但内口可以是一个或多个的肛瘘。按病变的深浅分类：低位肛瘘，瘘管管道位于外括约肌深层以下的肛瘘；高位肛瘘，瘘管管道位于外括约肌深层或耻骨直肠肌以上，内口在齿线或齿线以上的肛瘘。
肛瘘可以治好，对于肛瘘治疗的原则就是采取手术方法进行治疗。单纯性肛瘘未见症状反复发作，肛瘘处于静止期，可以暂时观察。对于肛瘘反复肿痛、流脓、反复发作，因为肿痛、流脓反复发作可以刺激局部组织增生，反复增生容易造成局部组织恶变的可能性，所以及早采取手术的治疗方法，彻底解决。