在急性炎症期和复杂性肛瘘反复发作时，可出现不同程度的发热、或伴有消瘦、贫血、体虚等长期慢性消耗症状。大部分肛瘘由直肠肛管周围脓肿引起，因此内口多在齿状线上肛窦处，脓肿自行破溃或切开引流处形成外口，位于肛周皮肤上。
肛瘘属于肛门周围的炎症，溃烂，然后就是形成窦道等。肛瘘药物治疗效果比较差，需要考虑手术治疗。肛瘘术后也存在一定的复发概率，注意个人的习惯，尽量的不要吃刺激的食物，另外就是局部的地方注意卫生。
肛瘘手术后复发是临床上并不罕见的一个现象，内口处理不当、肛门腺处理不当、瘘支管及其瘘空腔清除不彻底就好引起复发，必须进行降糖治疗，只有这样，才可能取得良好的治疗效果。
可能是解剖因素。肛门括约肌纵横交错，肌肉的舒张、收缩可影响管腔的塌陷闭合。或是引流不畅，脓液排除后肛门皮肤外口可能暂时闭合，管道及脓腔内的分泌物排出受阻，使管道不能自行愈合。
肛瘘手术后有复发可能性，需要当地正规综合性医院肛肠科检查明确，必要时肛诊等检查，确诊复发必要时进一步手术治疗。忌辛辣刺激食物，饮食清淡，注意肛门清洁卫生，应用消炎膏，抗生素治疗等医院肛肠科检查明确，必要时进一步手术治疗复发肛瘘。
低位复杂肛瘘疾病容易复发，所以要注意坐时要让肛门处于悬空状态，便后用水清洗肛部，可以在医院买个电动肛门护理包，里面有肛部清洁器帮助便后清洗，肛部药浴盆放在马桶上熏蒸坐浴，坐姿时用肛部支撑垫帮助悬空伤口，促进水肿消退。
