盐酸舍曲林禁用于对舍曲林过敏者。禁止与单胺氧化酶抑制剂合用。维持治疗期间，用药应根据疗效调整剂量，并维持最低有效治疗剂量。有的患者可能还会头晕，但是一到两周以后，患者就会耐受这些副反应，这个药是一个比较安全的药物，没有明确的禁忌证，当然对于这个药如果过敏的话就不能吃了。
一般来说，盐酸舍曲林作为选择性5-羟色胺再摄取抑制剂，副作用较少。
目前常见的副作用主要是服药初期的胃肠道反应，如口干、口苦、恶心、呕吐、便秘、腹泻等。这些症状可以在服药后一周左右消失。还有其他副作用，如头晕或头痛，以及过度兴奋甚至焦虑，如果严重的话，也可能导致躁狂的风险。
对于男性患者，舍曲林的副作用可能导致射精延迟。如果长期服药，肝肾功能可能受损。
一般情况下，盐酸舍曲林片治疗早射有一定的作用。具体分析如下：
盐酸舍曲林片，主要是一种能缓解紧张焦虑的药物，临床上也有治疗早射的功效。对于男性的早射，可以在医生指导下使用帕罗西丁片、氟西丁片等药物进行治疗。如果是由于龟头敏感导致的早射，可以在局部使用利多卡因进行局部麻醉，从而减少对阴茎的龟头性，从而缓解症状。
常见的副作用表现为抗胆碱能作用，例如可引起口干、便秘、排尿困难。有些可以表现为头痛、头晕，嗜睡。或者出现心悸、心前区不适等。双相障碍抑郁患者，长期服用，可以诱发躁狂发作。
盐酸舍曲林片是一种抗抑郁药，主要适用于抑郁症和强迫症的治疗，服药期间要避免饮酒。育龄妇女在使用盐酸舍曲林片期间要采取避孕措施，因为这个药具有一定的生殖毒性。另外，舍曲林可能会导致出现困倦、头晕，影响思维、判断能力，所以用药期间也要避免驾驶或者操作机器。
患者使用盐酸舍曲林可能会有一些胃肠不适、恶心等副作用。
比如最明显的作用就是消化道刺激症状，患者出现恶心甚至呕吐的情况，食欲下降。并且还会出现乏力，头晕等症状。但是出现这种状态不需要处理，因为一般在一周之后会自行的改善甚至消失。大剂量的服用可能会诱发癫痫，突然停药可有撤药综合症，比如失眠，焦虑，恶心，出汗。
治疗抑郁症应每日服药一次，与食物同服或不同服均可，早或晚均可。通常治疗抑郁症和强迫症的有效剂量为50毫克/日。如出现副作用症状明显，且长时间未消失，应至医院检查。