区别是，盐酸舍曲林片应用于多种焦虑障碍，盐酸舍曲林片的起效最快，盐酸舍曲林片改善躯体化症状效果显著优于盐酸帕罗西汀片。盐酸舍曲林片具有Sigma受体的亲和作用。
吃盐酸帕罗西汀片是不可以短期内怀孕的，最好是间隔3-6个月怀孕。
盐酸帕罗西汀片是一种抗抑郁症药物，女性服用药物后，可能会导致早期胚胎的发育受到影响，可能会胚胎停育、胎儿发育畸形等，从优生优育的角度上讲，女性在备孕期间以及怀孕后的三个月内不应该服用此类的药物。
建议女性在怀孕三个月的时候，注意调整身体，避免烟酒、细菌、药物、放射线等不利影响，保持营养均衡，增强身体的抵抗力和免疫力，有利于积极的备孕，保证怀孕后胚胎的生长发育。
可以用于抑郁症的临床治疗，也可用于强迫症、惊恐障碍、社交焦虑障碍等的临床治疗，足量足疗程都可以有不错的效果。可能会有撤药反应，在撤药的时候应该缓慢进行。该药副作用主要包括恶心、腹泻、失眠、不安和性功能障碍等，多数副作用持续时间短，多为一过性的，患者多能耐受，大概十天左右就会慢慢消失。
一般来说，盐酸舍曲林作为选择性5-羟色胺再摄取抑制剂，副作用较少。
目前常见的副作用主要是服药初期的胃肠道反应，如口干、口苦、恶心、呕吐、便秘、腹泻等。这些症状可以在服药后一周左右消失。还有其他副作用，如头晕或头痛，以及过度兴奋甚至焦虑，如果严重的话，也可能导致躁狂的风险。
对于男性患者，舍曲林的副作用可能导致射精延迟。如果长期服药，肝肾功能可能受损。
盐酸帕罗西汀片的副作用常见有胃肠道的不适，如恶心、厌食、腹泻等，也可出现头痛、不安、乏力、嗜睡、失眠、头昏等。少数不良反应可有过敏性的皮疹及性功能减退，突然停药可见撤药综合征，如失眠、焦虑、恶心、呕吐、胃肠胀气，还有乏力、性功能障碍，如阳痿、性欲下降等。
长期使用盐酸帕罗西汀片可能会出现胃肠道不适，如恶心、厌食、腹泻等。亦可出现头痛、不安、无力、嗜睡、失眠、头晕等。少见不良反应有过敏性皮疹及性功能减退。然停药可见撤药综合症，如失眠、焦虑、恶心、呕吐和胃肠胀气；其他还有乏力、性功能障碍(包括阳痿、性欲下降)副作用。低钠血症者较少见，主要发生在老年人，通常在停药后迅速恢复。而且在维持治疗期间药物剂量未变，也没有任何心理社会应激事件，却可能出现抑郁复发。