膝盖囊肿通过药物和保守治疗方法无法消失或减小的，要进行手术处理，手术切除囊肿是可以康复的，囊肿是属于良性的病变，注意不要服用含铁或含铁的维生素，以清淡食物为主。
腱鞘囊肿可伴有长期劳损、感染等，伤害和其他原因之间存在某种联系。患者一般会出现一侧或者双侧疼痛的症状，也有一部分是单侧疼痛。以病部圆形肿块为主，有些酸疼。随着人们生活水平不断提高，越来越多的人患有不同程度的腱鞘炎症状。对腱鞘囊肿有非手术治疗与手术治疗两种。非手术治疗就是用药物或者是针灸来进行治疗。保守治疗是用挤压的方法将腱鞘囊肿击碎，接着，泡液就渐渐地自己吸收了，但也存在一定复发机会。手术疗法是对已经发生了病变的患者进行彻底的破坏。操作方法是可摘除腱鞘囊肿，手术后注意防护，避免反复发作。
肌腱囊肿可保守治疗，也可以手术进行治疗。
肌腱囊肿又称为腱鞘囊肿，指肌腱腱鞘或关节处的韧带发生劳损性炎症，引起局部组织膜下积液，积液量渐多，可形成囊肿。腱鞘炎主要是因为长期的紧张劳累以及不良生活方式等因素造成。腱鞘囊肿可局部压揉，有时可将积液捏碎吸收囊壁粘连即可。如囊肿较大，不只影响美观，也会带来痛苦，就必须考虑手术切除。
宫颈的上皮细胞，随着体内的雌激素水平的高低会出现变化，宫颈纳氏囊肿不会影响怀孕。如果宫颈囊肿比较大或多发，或引起白带异常的症状，需要进行治疗。可以做微波、利普刀、冷冻、激光等物理治疗，在月经干净后三到七天可以做治疗，治疗以后一个月内不要性生活，治疗后要注意复查。
脑囊肿的治疗方法，主要需要根据或者囊肿的类型，囊肿的大小，以及囊肿是否引起患者相关的症状，来决定的治疗方式，对于没有任何症状的脑部囊肿，特别是脑部的蛛网膜囊肿、松果体囊肿等，并不需要特别的外科治疗，而对于引起比较明显症状的囊肿，例如表皮样囊肿等，在诊断明确之后，需要在神经外科，通过显微神经外科手术来进行囊肿切除，症状多能够逐步消失。
