腱鞘囊肿不及时治疗是有后遗症的，第一种后遗症就是造成一定的功能障碍，腱鞘囊肿会引发腕部无力，患处不适或疼痛，主要是酸痛或者是放射性痛，治疗得不及时，最后可能需要手术治疗。
下肢疼痛一般是神经根水肿炎症导致的，经过脱水消炎止痛等可以缓解，要是手术刀口部位疼痛，要排除有粘连，无菌性炎症等，有必要去医院复查一下看看。建议忌辛辣刺激，饮食清淡注意休息，可以外科检查，应用消炎止痛药物。
囊肿可以发生在任何部位，一般里面都是液体，包裹在一层膜内，就像一个皮囊。一般不会有严重的后遗症。现在对会厌囊肿可以通过喉镜直接手术，只要彻底剥离囊壁，治疗效果很好。囊肿癌变的可能较小，但手术切除后必须做病理切片确诊。
大部分患者是不会有后遗症的。这种疾病一般早期不会有什么明显的症状，由于生长缓慢，所以压迫症状并不是特别明显，可能是在因为其它原因检查头部ct或者磁共振发现患有蛛网膜囊肿。如果囊肿比较大，可以引起头痛，头晕等临床症状。可以考虑手术治疗，手术可以采取囊肿壁的部分切除手术。
囊肿术后会有出血和手术创伤面现象，可以说术后感染是卵巢肿囊的第一后遗症。平时饮食方面注意以清淡食物为主，禁食辛辣刺激食物。做好术后护理工作，避免创伤面出现细菌感染。平时注意休息，多吃水果和蔬菜。
附睾囊肿手术后遗症有：附睾有时会出现小囊肿，多数都是潴留性囊肿，有炎症引起的囊肿比较少，如果没有症状，囊肿又比较小不需要治疗。如果症状比较明显，囊肿相对比较大，可以手术切除附睾。