手术治疗主要分根治性手术和姑息性手术，根据患者病情采用不同疗法，放化疗也治疗胆管癌常用方法，对患者细胞会造成一定伤害，患者在选择疗法时要慎重。还可以选择中医治疗，因为直接对症下药，副作用还极小。
胆管癌是一种恶性度高的肿瘤。它的发病因素可能与患有胆管结石时间长、有原发性硬化性胆管炎等一些疾病有关系。目前在临床上有条件给予采用手术治疗，后期的放射治疗和化疗等方法，但是这个肿瘤预后一般不好。
早期胆管癌主要采取手术切除。因为胆管癌的化疗以及放疗效果并不算好，所以临床上如果能手术，即使姑息性的切除，也比单纯的引流术要好。对于上段的胆管癌，它分为四种类型。
肝门部胆管癌是胆道系统常见的恶性肿瘤，目前治疗肝门部胆管癌的方法繁多，有手术切除、化疗、放疗、免疫治疗、生物治疗、介入治疗等，但最有效的方法仍为手术切除治疗。对于无法手术的患者，进行引流或介入方法以延长生命，提高生存质量。
在治疗上应该采取积极的手术治疗，把原发性肝癌的位置进行切除。如果手术不耐受，身体条件比较差，心肺功能又比较差，可以配合中药的巩固治疗。中医对肝内胆管切除以及不能耐受切除的病人都是有很好的作用，可以杀灭血液中残留的肿瘤细胞，还可以通过介入导管的灌注化疗。
肝门部胆管癌的首选治疗方式是手术切除，血管骨骼化、联合肝叶切除、扩大淋巴结清扫和胆道重建是肝门部胆管癌根治术的主要方面。必要时联合各类肝叶和血管切除技术，可以提高切除成功率。