不同肿瘤患者靶向治疗的药物不同，因此靶向治疗的疗程也是不同的。如果是应用抗EGFR的靶向药物吉非替尼，如果有效需要持续服用，直至病情进展。治疗CD20(+)的弥漫大B细胞淋巴瘤的单克隆抗体，一般应用6-8个周期之后。
靶向治疗通常需要进行4-6个疗程化疗，而靶向治疗，并没有过多的疗程的限制，主要是用于对手术、放疗、化疗等不敏感的病者，或者在这些治疗之后，肿瘤仍然进展的病者，靶向治疗也不是次数越多越好也可能会出现一些并发症，所以靶向治疗的具体疗程，需要根据具体状况来决定。
不同肿瘤患者靶向治疗的药物不同，因此靶向治疗的疗程也是不同的。根据病人不同的癌症种类、病人的病情、身体状况来决定的。靶向药原则上可以一直使用，直到病人产生耐药。
直肠癌患者采取靶向治疗并不是吃几个疗程的问题，只要患者能够耐受或者不产生耐药性，可以一直吃1到2年，根据药物是否产生了耐药以及病情的评估，进行更换药物或者继续服用。
肺癌靶向治疗要六个疗程，二次为一个疗程，一星期一次，靶向治疗，是在细胞分子水平上，针对已经明确的致癌位点，来设计相应的治疗药物，药物进入体内会选择致癌位点来相结合发生作用，使肿瘤细胞特异性死亡。
肺癌靶向治疗需要住院。靶向的治疗是以肿瘤细胞具有的特异性的分子为靶点，应用分子靶向药物，特异性地阻断该靶点的生物学功能，从分子水平来逆转肿瘤细胞的恶性生物学行为。