化疗是目前常见的杀灭肿瘤细胞的重要手段，但对人体的伤害也是非常明显的。副作用常表现为恶心、呕吐、腹泻、食欲不振、躯体疼痛、白细胞数量、血小板数量急剧下降。白细胞极度下降，会导致身体免疫力受到破坏，无法接受进一步的处理，需要用升高白细胞。恶心、呕吐属于常见的消化道反应，需要应用止吐来缓解。腹泻可以应用止泻缓解不适。
身体衰弱，可出现周身疲乏无力、精神萎靡、出虚汗、嗜睡等。免疫功能下降，化疗药物可损害的免疫系统，导致免疫功能缺陷或下降。骨髓抑制，大多数化疗药物均可引起骨髓抑制。炎症反应，发热、头晕、头痛、口干、口舌生疮等。
首先会对自身免疫力造成严重损害，会出现嗜睡、出虚汗多、精神萎靡、浑身没有力气。尤其是长期化疗会对膀胱造成损害，造成膀胱炎。还有化疗也会对肝功能造成损害，轻度的可能会出现肝功能不正常的症状，比较严重的还会造成肝脏中毒。化疗还会损害神经系统。
腹腔热灌注化疗虽然存在一个腹膜的屏障，但是这种方法的毒副作用比较大，而且疗程很长，很难忍耐。该方法可以和肿瘤直接接触，有助于抑制肿瘤的生长发育，但是会带来疼痛感，在治疗的时候要注意温度的把握，如果温度过高，体内的正常组织会受到损伤，也不利于正常细胞的生长，如果温度过低则不能达到治疗效果。
常见的不良反应为胃肠道症状，主要包括腹泻、恶心、呕吐以及黏膜炎；血液系统的不良反应包括中性粒细胞减少、血小板减少；神经系统反应为计量累积性的外周神经感觉病变。