直肠癌患者II期及以上的患者具有化疗指征，大多数患者需要进行术后辅助化疗或术前新辅助化疗。应用较多的化疗方案包括铂类联合5Fu化疗以及伊立替康联合5FU类的化疗。
直肠癌的化疗方案一般就是以氟尿嘧啶为主要的化疗方案，比如有FOLFOX方案，FOLFOX就是奥沙利铂加氟尿嘧啶，然后还有卡培他滨加氟尿嘧啶这个方案。现在应用比较广泛的是奥沙利铂加其他治疗药物口服也可以。如果病情较晚，可以行基因检测的治疗，与化疗、靶向治疗相结合。
目前临床治疗方案应该是以奥沙利铂、亚叶酸钙和五氟尿嘧啶的治疗为主，临床治疗一般会选择两周一个疗程，围绕手术围手术期前后可能需要进行六个月左右的治疗，一般给药是奥沙利铂、亚叶酸钙和五氟尿嘧啶的联合应用，第二个治疗方式可以选择亚叶酸钙、五氟尿嘧啶，也是需要两周一个疗程，共用六个月左右，目前卡培他滨也可以选择，也是治疗六个月，但是每个疗程可能需要三周，一般都需要结合患者的病情确定选择治疗方式。
直肠癌对人体的健康危害很大，需要看病情来决定相应治疗方法，首选的治疗是性手术切除，防止化疗副作用对机体的损伤，同时提高病人的生活质量。实践证实，中药人参皂苷对控制转移，稳定病情，提高生活质量等方面都有切实的效果。
可手术治疗，对于手术处理不了的或术后为防止转移的，只有再继续进行化疗。化疗同时需服用中药，进行一个长期而有效的辅助治疗，手术的方式和肿瘤距离肛门远近有很大的关系，如果不能手术，只能是考虑化疗，但化疗方案是需要病情来决定，需要肿瘤科医生指导下规范治疗。
直肠癌术后化疗时间间隔不宜过短，因为病人手术治疗之后身体比较虚弱，需要调养一段时间等身体恢复差不多时才能进行化疗，一般在术后3~4周身体就已经恢复差不多，就可以开始化疗治疗，需要坚持化疗6个疗程，一个疗程在21天左右，需要坚持化疗半年左右时间。