早期肛乳头瘤可用冷冻术，冷冻法多用于痔病的治疗，用于肛乳头瘤的治疗报道不多，当瘤体较小时比较适合。总体感觉复发率高些，且需要冷冻设备，没有切除法简便，也没有切除法易于开展使用。
会有排便不尽感，在排便后，还是有排泄物留在肛门内，有下垂的感觉，这就是排便不尽感。有些女性在月经期这种感觉会更加强烈。乳头瘤随排便反复脱出肛门外，肛门受到摩擦导致炎症的发生，引起肛内有分泌物流出，刺激着肛周的皮肤。
肛乳头瘤是肛乳头经常性的被大便摩擦及慢性的炎症刺激等诱因引起的，这个如果症状不是很明显的话，也可以暂时不用进行手术，可以每天进行温水坐浴，平时饮食上主要还是不要吃辛辣的食物，防止便秘。如果症状明显，或保守无效的话，还是需要考虑手术的。
肛乳头瘤治疗方法是保守治疗，勤观察，灌肠效果很好。可以温水或药物坐浴，局部热敷可以改善血液循环，促进炎症吸收。平时注意肛门卫生，便后及时清洗。吃东西要吃清淡无刺激的，多喝温水，不能喝酒。
肛乳头瘤可以通过视诊和肛诊可以检查出，但是最后的确诊需要切除后行病理化验检查。肛乳头瘤是指肛乳头因粪便和慢性炎症的长期刺激增大变硬，肛乳头瘤是肛门直肠常见的良性肿瘤之一。
肛乳头瘤与生活饮食习惯和便秘有关，如果症状较重，保守治疗无效，就应该尽早手术治疗。可以选择去正规公立医院进行手术治疗，术后要保持生活规律，清淡饮食，避免烟酒刺激。