可以考虑定期观察，防止恶变.如果囊肿较大，可以考虑传统手术，开刀切囊肿的方法。也就是对囊肿开窗引流治疗或剥离治疗，也可以选择腹腔镜下切囊肿，切口比较小，但是花费相对多一些，还可以选择中医保守治疗。
口腔囊肿以手术治疗效果较好，其他的像激光、微波热凝、冷冻或局部注射药物也能治疗，但容易复发。因为囊肿周围往往有肿大的腺疱，在手术时需要一并切除，以免术后复发。
乳腺囊肿是临床中比较常见的一种乳腺疾病，得了乳腺囊肿的应该根据囊肿的大小，采取治疗措施，对于偏小的几个毫米以下的乳腺囊肿可以不必用特殊的治疗方法，定期观察就可以。对于较大的乳腺囊肿，可以采取介入穿刺抽吸的方法将囊肿内的液体抽出，局部加压包扎，也可以通过手术切除，将囊肿完整的切除后缝合。这两种方法治疗乳腺囊肿效果都比较理想。
腱鞘囊肿可伴有长期劳损、感染等，伤害和其他原因之间存在某种联系。患者一般会出现一侧或者双侧疼痛的症状，也有一部分是单侧疼痛。以病部圆形肿块为主，有些酸疼。随着人们生活水平不断提高，越来越多的人患有不同程度的腱鞘炎症状。对腱鞘囊肿有非手术治疗与手术治疗两种。非手术治疗就是用药物或者是针灸来进行治疗。保守治疗是用挤压的方法将腱鞘囊肿击碎，接着，泡液就渐渐地自己吸收了，但也存在一定复发机会。手术疗法是对已经发生了病变的患者进行彻底的破坏。操作方法是可摘除腱鞘囊肿，手术后注意防护，避免反复发作。
一般情况下，卵巢囊肿患者可以通过医学检查、手术治疗等方式进行治疗。具体情况分析如下：
如果是直径在5cm以下的卵巢囊肿，同时检查CA125、CA19-9、CEA、AFP等指标是否在正常范围内，可以在月经结束后进行妇科彩超检查。如果是一个直径超过5cm的卵巢囊肿，同时还要做妇科彩超检查。卵巢囊肿外科治疗通常是对有需要或尚未绝经的妇女，应行腹腔镜下摘除或剖腹切除。如果是绝经期后的妇女，或者是因为有恶性肿瘤的原因，需要进行手术治疗。
