有的心房颤动能根治，如孤立性房颤、阵发性心房颤动等，对此种情况可先考虑转复，转成窦性心律后，若日后不再发作，则算根治。
如转复失败，亦可行射频消融术（RFA）.射频消融术成功率可达甚至更高，获得成功后亦等于痊愈，但对持续性心房颤动（房颤），和永久性心房颤动（房颤），则难以根治，通常仅采用控制心室率和抗凝等方法。
持续性房颤的治疗涉及到其病因的治疗。与甲状腺功能亢进一样，甲状腺功能亢进可引起持续性房颤，因此治疗甲状腺功能亢进有助于持续性房颤的治疗。控制心室率，重建窦性心率，预防栓塞。由于地高辛能增加房室传导的延迟和阻滞，故通常可通过地高辛控制心室率。例如，独自地高辛不够有效。维拉帕米(维必定)最有效。
心房颤动能否治愈要看心房颤动的种类，如果是一个首发的心房颤动，时间没有超过48小时，首先就要考虑转复房颤，可以采用电复律也可以采用药物来转复，一旦转复成功也算治愈。如果心房颤动的时间比较长，再是一个阵发房颤超过48个小时，就可以考虑转复，前提就是要充分的抗凝。
在一部分人当中房颤是可以治好的，房颤的导管射频消融手术，或者是外科的迷宫术，是对房颤从电生理机制上进行的一种干预治疗，能够在一定程度上达到长期维持正常的窦性心率的效果。当然不是所有的人都能够通过这两种手术达到治好的效果的。对于一些没有器质性心脏病的人，特别是特发性房颤的人，通过导管射频消融手术或者是外科的迷宫手术，能够达到长时间的维持窦性心律，这些人的效果是比较好的。
48小时内心房颤动可以直接复率，否则需要前三后四周的抗凝治疗，房颤治疗主要是控制心室率，复率，预防并发症三种，房颤发病和高血压，冠心病，瓣膜病，甲亢有关系。可以到心内科诊治，注意休息劳逸结合，避免焦虑，戒烟酒，避免刺激性食物。
心房颤动治疗强调长期综合管理，即在治疗原发疾病和诱发因素的基础上，积极预防血栓栓塞、转复并维持窦性心律及控制心室率，医生会根据病因、临床症状不同等给予药物、手术或者射频消融治疗等不同的治疗方案。
对于已不适合药物转复或药物及电复律转复失败的老年患者，治疗目的则是控制心室率。目前常用药物有洋地黄、β受体阻断药、钙通道阻断药、胺碘酮等。中医药对房颤的主要干预手段有药物治疗、针灸疗法等，例如参附注射液，温补心阳，安神定悸。用于心阳不振所造成的心慌不安、胸闷气短。