川崎病如果治疗不当，可能会有后遗症，其中包括心血管系统并发症或者是休克、巨噬细胞活化综合征，也有可能出现其他并发症，其中冠状动脉并发症发生率高，冠状动脉方面的后遗症最常见的就是动脉扩张和冠状动脉瘤。
川崎病的后遗症有，心血管系统并发症或者是休克、巨噬细胞活化综合征，也有可能出现其他并发症，其中冠状动脉并发症发生率高，冠状动脉方面的后遗症最常见的就是动脉扩张和冠状动脉瘤。
川崎病可能会有暂时性冠状动脉病变，也就是出现川崎病的后遗症。其中约70%的冠状动脉扩张可以自行恢复，约1%的患儿会发生永久性冠状动脉病变，巨大的冠状动脉瘤常发生狭窄。如遇此种情况，需要采取心脏介入或者外科手术治疗。因此，一旦确诊川崎病，在急性期需积极治疗，以最大限度减轻川崎病后遗症的发生率。
川崎病病人在治好以后是不会留下后遗症的，但是也有一小部分的病人会发生后遗症，主要还是看孩子的体质来决定。川崎病一定要及时治疗，否则还有可能引起孩子心、肝、肾等各脏器的损害。这一病症容易复发，所以在治疗过程中一定要做到完全治好再停止治疗。
川崎病后遗症可能会引起凝血功能的障碍，建议及时治疗。
如果儿童川崎病没有得到及时治疗，一般会出现血液中的血小板计数明显的升高，就会引起凝血功能的障碍，造成高凝状态，容易引起血液黏稠，严重者可能会造成静脉的血栓，从而引起冠状动脉的损伤。
部分川崎病的病变，还可能会造成孩子冠状动脉的扩张，甚至形成冠状动脉瘤的。
川崎病毒通常指川崎病。一般情况下，川崎病是否会引起后遗症需要根据患者的具体情况来决定，如果病情轻微并且治疗及时，一般不会引起后遗症；如果病情较重并且治疗不及时，通常会引起后遗症。
川崎病是因病原菌感染而诱发免疫损伤的一种疾病，如果患者病情较轻，可能会出现全身性的中小动脉的血管炎，此时如果及时应用丙种球蛋白进行治疗，一般能很快治愈，并且不会引起后遗症。如果患者病情较重，并且治疗不及时，可能会造成冠状动脉扩张或冠状动脉瘤，引起心脏扩大、心律失常、心功能不全等后遗症。